«Се есть пуркгаториум наш христианский, которого ради веры верныи (одни межу языки, не знающими Бога, другии от латины, познавших Бога, и паки гордостию отпадших, и едино с неверными мудрствующих)... очищаются наши християне: безчестием, поруганием, поносами, клеветами, лжеглаголанием, посмеянием, гонением, беднотворением, уничижением, томлением, биением, в темницах затворением, мучением – антихристового наследия, папежские веры, пуркгуются (очищаются от грехов) наши християне истинныи в жизни сей». В «Извещении кратком о латинской прелести...» как бы от лица католиков Иоанн исторически точно описал формы преследования православных, практиковавшиеся в Речи Посполитой: «Имете их (православных) и мучите досадами и бедами. Вы, войтове, бурмистрове, ланвойтове, власт мирская, градская и повсюду, не дадете Руси ни едино пространство в жизни их, в судех по Руси не поборяйте, паче же и крывдите, в суседстве любви не показуйте, ниже с ними ся общете, паче же их ненавидите. В куплях, торгах, ремеслах русин с папежником волности единой да не имат. В цехах ремесницких русину быти не достоит, доколе ся не попапежит. На власти войтовства и бурмистровства и прочиих строительств от русского народа да ся не поставляють, доколе ся у папежа не уверуют. Аще же сим Руси не досадите и своей христянское веры отступити и папе идолопоклонитися не хощут, набоженство (богослужение) им разорете, на праздники старого календаря звонити не дадете, новый же святити и празновати с силою понудете... Аще же и еще не послушают, Сакрамент Христов (Святые Таины) обезчестете, на землю пролейте, и ногами поперете, и потопчете, церкви запечатуйте, и от всех стран бедно творете, и досаждайте, да поне сими бедами и досадами повинутся поклонитися папе и Костелови Римскому. Аще же... сими досадами им не одолеете, в темницах затворяйте и без вин вины на них налагайте, бийте, безчестете и убийте в имя найсвятейшего папы – прощение и разрешение от него приймите и в чистцю (чистилище) за то и за вся беззакония по смерти очиститеся». В «Краткословном ответе Петру Скарге...» Иоанн обвиняет польского короля в том, что он «гвалтом (насилием) правоверных до латынства власти светской приводити понуждает». Полемист сопоставляет короля с Навуходоносором, приказавшим бросить в печь трёх вавилонских отроков за исповедание веры в единого Бога. В сочинениях Иоанна отроками выступают «убогие русинцы», не желающие поклониться идолу – папе Римскому, католиков Иоанн часто сравнивает с языческими императорами, преследовавшими христиан. Писатель считает, что в государственном управлении «стосугубней... турки честнейшие ест пред Богом в суде и правде якой-такой, нежели крещеные ляхи».