В гностической литературе отдельные элементы евангельского сюжета о Крещении Господнем получали смысловое наполнение, далёкое от церковной традиции. Согласно свидетельству Иринея Лионского, гностик Керинф, излагая распространённую в гностических кругах версию о природе Христа, учил, что посредством крещения от Иоанна простой человек Иисус был приуготовлен «низшей премудростью» для соединения с небесным Христом, посланным на землю божественной премудростью, так что на Иисуса «от превысшего первого начала сошёл Христос в виде голубя». Согласно учению валентиниан, на человека Христа при крещении сошёл в виде голубя Спаситель из Плеромы. По другой версии, валентиниане учили, что, «когда Иисус пришёл на воду, на Него снизошла в виде голубя... сила... семя Отчее, имеющее в Себе и Отца и Сына… И это есть Дух, глаголавший устами Иисуса, исповедавший Себя сыном человеческим, явивший Отца, сошедший на Иисуса и соединившийся с Ним». Этой традиции близко свидетельство, сохранившееся в приписываемом Киприану Карфагенскому трактате «De rebaptismate» (III в.), из утерянного апокрифа «Проповедь Павла» («Praedicatio Pauli»). В нём говорилось, что Иисус осознал Свой грех и под влиянием уговоров Своей Матери принял крещение от Иоанна: «...Когда Он крестился, огонь явился над водою («ignem super aquam esse visum»), о котором не сказано в Евангелиях».