Уже в послании Урания и в Мартирологе Иеронима Стридонского Ианнуарий назван неаполитанским святым. В V в. над катакомбой была сооружена базилика во имя Ианнуария, куда, по мнению исследователей, были перенесены его мощи. Св. Агнелл, епископ Неаполя (673–694 гг.), основал при церкви св. Ностриана диаконию во имя Ианнуария. Захватив в 831 г. Неаполь, беневентский герцог Сикон перенёс мощи Ианнуария в свой город, где они были помещены в кафедральном соборе Богородицы Иерусалимской. В 1154 г. по инициативе сицилийского короля Вильгельма I Злого, считавшего Беневенто недостаточно надёжным местом для хранения святыни, мощи были перенесены в аббатство Монтеверджине. По приказу короля Карла II Анжуйского (1285–1309 гг.) их поместили в бюст-реликварий из позолоченного серебра и в 1305 г. выставили для поклонения. Сын Карла, неаполитанский король Роберт, повелел также изготовить реликварий для ампул с кровью мученика. С 1480 г. мощи св. Ианнуария хранились под главным алтарём монастырской церкви. Однако в Неаполе почитание Ианнуария не угасло. Во имя Ианнуария был освящён кафедральный собор, сооружённый при короле Карле II. В городе оставались одеяние мученика и ампула с его кровью. Согласно местному преданию, по молитве к Ианнуарию Неаполь был спасён от гибели во время извержения Везувия в 471 г. В 1497 г. по договорённости между Неаполитанским архиепископом Алессандро Караффой и его братом кардналом Оливьеро Караффой (1430–1511 гг.), в юрисдикции которого находилось аббатство Монтеверджине, мощи Ианнуария были возвращены в Неаполь и помещены в кафедральный собор. В 1964 г. по указу кардинала Альфонсо Кастальдо, архиепископа Неаполитанского, профессором Дж. Ламбертини была проведена каноническая рекогниция мощей. Хорошо сохранившиеся останки принадлежат мужчине 35–40 лет, высокого роста – около 1,9 м. Они находились в овальной погребальной урне с надписью: «C(orpus) S(ancti) Ianuarii Ben(eventani) Epi(scopi)» («Тело св. Ианнуария, Беневентского епископа»). Терракотовая урна высотой 28 см и длиной 78 см относится к лангобардской эпохе (VI–IX вв.). Урна была завёрнута в бархатную ткань, запечатана и помещена в деревянный ларец. Ларец находился в бронзовом реликварии 1511 г. В настоящее время урна с мощами Ианнуария хранится в алтаре крипты кафедрального собора. В октябре 2008 г., во время визита в Москву Неаполитанского архиепископа кардинала Крещенцио Сепе, частица мощей Ианнуария была передана РПЦ. Останки спутников Ианнуария имеют особую историю почитания. Мощи мучеников Феста и Дезидерия первоначально находились в посвящённой им церкви за городскими стенами Беневента (ныне Беневенто). В 824 г. по инициативе герцога Сикона, так же как и мощи Ианнуария, они были перенесены в новый кафедральный храм Богородицы Иерусалимской. В первой половине XII в. вместе с мощами Ианнуария они были вывезены в аббатство Монтеверджине, а оттуда в Неаполь, где ещё при епископе Стефане II (767–800 гг.) был основан монастырь св. Феста. В настоящее время мощи хранятся в кафедральном соборе Неаполя. Мощи св. Соссия были перенесены в Мисен, где над гробницей мученика впоследствии воздвигли церковь. В Неаполе епископ Кальв (750–762 гг.) основал ораторий в честь мученика.