После падения фашистской диктатуры Муссолини 25 июля 1943 г. Пий XII начал содействовать антифашистскому движению. Но это было не более чем реакция на прогнозируемый закат фашизма, когда союзники СССР начали наступление на Италию, где активизировалось движение сопротивления.

Арестовав Муссолини, король Виктор Эммануил III назначил его преемником маршала Пьетро Бадольдо, предоставив ему право сформировать новое правительство. Бадольдо издал декрет о роспуске фашистской партии, но не сумел предотвратить оккупацию Италии немцами в декабре 1943 г. На оккупированной территории Италии вернувшийся из Германии Муссолини создал марионеточное неофашистское государство со столицей в курортном городке Сало, но в начале 1944 г. в Рим вошли англо-американские войска. Король Виктор Эммануил III, скомпрометировавший себя сотрудничеством с фашистами, передал свои права наследному принцу Умберто II, и было сформировано новое антифашистское правительство под председательством Бономи.

На референдуме 2 июня 1946 г. о государственном устройстве Италии столкнулись два течения – республиканцы и монархисты. Север высказался за республику, юг – за монархию. С небольшим преимуществом победили республиканцы, и 13 июня Умберто II опубликовал заявление о том, что подчиняется «насилию» и «революции», покидает свой пост и переселяется в Португалию, где в дальнейшем живет под именем «граф ди Сарре», а Италия 18 июня 1946 г. официально провозглашена республикой.

С 1 января 1948 г. принята конституция Италии, в соответствии с которой первым ее Президентом стал Энрико де Никола. При подготовке конституции развернулась дискуссия о взаимодействии Церкви и государства. Социалисты отказывались признавать «Латеранское соглашение» 1929 г. между папой и Муссолини о суверенности города-государства Ватикана. Пий XII грозил в случае непринятия этого соглашения развязать «религиозную войну» и отстоял свои права.

После окончания Второй мировой войны папа твердо занял проамериканскую сторону и в немалой степени способствовал «холодной войне». Он приветствовал создание НАТО, за что его прозвали «Атлантическим папой», а в 1949 г. отлучил от Церкви всех коммунистов. Одержимый идеей обратить Россию в католичество, Пий XII в 1952 г. опубликовал послание к народам России, где призывал население СССР отречься от коммунизма и обратиться в католическую веру. Не забывал он и другие народы, для чего ввел в состав кардинальской коллегии китайца (правда, с Тайваня), индийца, а также архиепископа Мозамбика, но почему-то португальца по национальности.

Покровительствуя чудесам и святым, Пий XII призывал к особому почитанию Девы Марии, провозгласив догмат о ее телесном вознесении на небо. 1953 г. он назвал «Годом Марии». С XVI в. Ватикан остерегался канонизировать римских пап, кроме Пия V, за их «мирские шалости». Пий XII нарушил эту традицию, и окружавшие посчитали, что он вынашивал идею о своей святости еще при жизни. Скончался он в 1958 г. от атеросклероза и был похоронен как простой смертный. С согласия папы его останки хотели забальзамировать, но вновь изобретенный метод оказался неэффективным.