В 1839 г. купцом Гаврилой Фёдоровичем Целибеевым и в 1846 г. купцом Фёдором Фёдоровичем Набилковым были пожертвованы три больших колокола для Казанского скита. В 1839 г. дрягильской компанией в собор был пожертвован образ преподобного Арсения, держащего в руках Коневскую икону, в серебряном окладе (ныне в соборе Нововалаамского монастыря). Со 2 марта 1849 г. рыбные ловли и оброки в Южнокексгольмском уезде были переданы в управление Финляндского правительства в обмен на денежную компенсацию. Крупнейшим строителем обители во второй половине XIX в. был игумен Израиль (Андреев), ученик Игнатия (Брянчанинова), переведённый из Введено-Остpовской обители (ныне Оятский в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы монастырь). Четвертьвековое настоятельство игумена Израиля (Андреева) было самым продолжительным за всю историю обители; он стал первым коневским иноком, удостоенным сана архимандрита. Служба в Коневском монастыре состояла из утрени, литургии, вечерни и правила. В 1860 гг. утреня начиналась в 3, а в праздники в 2 часа. Ранняя литургия начиналась после окончания утрени, поздняя – в 9 часов. Синодик об усопших включал больше 50 тыс. имён и читался пятью – десятью насельниками. В воскресенье после поздней литургии служили соборный молебен перед Коневской иконой и перед ракой преподобного Арсения. Вечерня зимой начиналась в 5, а летом в 6 часов; к ней присоединялось ежедневное чтение канонов Иисусу Сладчайшему, Божией Матери и Ангелу-хранителю, с акафистами Иисусу Сладчайшему и Божией Матери. Правило читалось после вечерней трапезы и включало молитву на сон грядущим, помянник и получение прощения и благословения от настоятеля; пение было знаменное или столповое. В 1860 гг. с запада к собору пристроили ризницу с башней. Большинство хозяйственных и жилых зданий были также возведены пpи игумене Израиле (Андрееве). В 2,5 км от монастыря, во Владычной Лахте, на месте, где стояли деревянные крест и часовня, на средства столичных благотворителей Сивохина, Мартынова и Николаева был построен новый скит с храмом в честь Коневской иконы Божьей Матери (заложен 30 июня 1874 г., освящён в 1876 г.) и келейным корпусом. В Сретенском храме пребывали главные святыни – мощи преподобного Арсения и чудотворный Коневской образ в резном киоте. Перед образом горела неугасимая серебряная позолоченная лампада, подаренная благотворительницей Анной Алексеевной Орловой-Чесменской. К изображению нимба вокруг главы Спасителя был привешен ковчежец с частью Ризы Господней, под иконой в ковчежце хранилась часть ризы Пресвятой Богородицы. В храме находилось значительное количество частиц мощей в десяти серебряных крестах и частица Древа Креста Господня. 28 мая 1862 г. по молитвам перед Коневской иконой в Санкт-Петербурге прекратился пожар. Благодарные купцы и окрестные жители пожертвовали средства на постройку новой часовни с келейным флигелем на Загородном проспекте. В 1862–1866 гг. академик архитектуры Иван Блажеевич Слупский спроектировал и возвёл новую часовню (освящена игуменом Израилем (Андреевым) 15 декабря 1866 г.). Часовню украшал резной двухъярусный иконостас и росписи. Главной её святыней был список чудотворной Коневской иконы.