В 1764 г. Коневский монастырь был выведен за штат, из Новгородской епархии переведён в Санкт-Петербургскую. В 1770–1771 гг. иеромонах Тарасий обратился с вопросом о возвращении Коневской иконы на остров, но разрешения не получил. Церковное начальство даже усомнилось в святости и достоверности Жития преподобного Арсения, поскольку тот почитался только в обители (Санкт-Петербургский государственный исторический архив). 15 июня 1785 г. Коневец посетил академик Николай Яковлевич Озерецковский и составил первое подробное описание Коневского монастыря, в котором проживали восемь человек во главе с иеромонахом Иоанникием; монастырь, окружённый деревянной оградой с угловыми башнями, имел пристань, главную усадьбу с каменной и старой деревянной церквами. В 1785 г. Санкт-Петербургский митрополит Гавриил (Петров) «наказал» валаамскому игумену преподобному Назарию (Кондратьеву) вместе с коневской братией избрать нового строителя. Недолго Коневский монастырь возглавлял смиренный и добродетельный монах Патермуфий (1785–1786 гг.), который возобновил на Коневце общежительный устав. Позже он принял обет молчания и подвизался в столичном Александро-Невском монастыре. Частая смена настоятелей стала одной из причин нарушения дисциплины братией, склонявшейся к своеволию и пьянству. Около 1790 г. митрополит Гавриил (Петров) пригласил на Коневец иеромонаха Адриана (Блинского), опытного старца, ранее подвизавшегося в Площанском в честь Казанскойиконы Божьей Матери, Симоновом Новом московском в честь Успения Пресвяятой Богородицы монастыре, а также в уединённой келье Брянских лесов. За время настоятельства (1790–1798 гг.) иеромонах Адриан сумел не только навести порядок в обители, но и построить девять братских келий, деревянную гостиницу, хозяйственные службы. 18 декабря 1797 г. император Павел I назначил ежегодное содержание монастырю как заштатному в размере 300 руб. Выборгская казённая палата 8 декабря 1798 г. выполнила императорский указ о передаче обители рыбных ловель на реке Вуоксе, в Кексгольмском уезде, в Ряйсяльском кирхшпиле: Ахвеницы (Ахвенитсенкоски ?), Тиуриса (Тиури ?) и Инонкоски (Уннункоски ?), и гейматных оброков с казённых крестьян Саккольского кирхшпиля (ранее Сакульский погост) того же уезда. 3 апреля 1799 г. иеромонах Макарий и иеродиакон Стефан, входившие в состав Валаамской миссии в Северной Америке, погибли во время кораблекрушения. Впоследствии на Коневце проживал на покое благочинный миссии архимандрит Гедеон (Федотов). За годы настоятельства иеромонах Адриан передал Коневскому монастырю значительное число икон в драгоценных окладах (в том числе Спасителя, Успения Божьей Матери (список Киево-Печерской), Тихвинскую, Казанскую с предстоящими преподобным Арсением, святыми Адрианом и Наталией и др.), утварь, 90 «церковных и отеческих» книг. В 1796 г. майор Пётр Иванович Челищев вложил в Коневский монастырь часть ризы Пресвятой Богородицы в хрустальном окладе. Екатерина Ивановна Савёлова пожертвовала иеромонаху Адриану часть ризы Господней. Старец Адриан возобновил уединённое жительство для опытных иноков.