Долгое время считалось, что инициатором контактов с клюнийцами, установленных в 1053 г., был король Леона и Кастилии Фернандо I (1037–1065 гг.). В 1059 г. он заключил с Клюни политический союз против королевства Арагон, подкреплённый ежегодной выплатой (census) в размере 1 тыс. золотых; в источниках отношения Фернандо I и клюнийцев описываются как особенно тесные и дружественные. Однако достоверность этих сведений была поставлена под сомнение, т.к. у исследователей нет сведений об испанских монастырях, подчинённых аббату Клюни при короле Фернандо I. Информация о ежегодных выплатах в пользу Клюни появилась в документах и хрониках лишь в годы правления короля Альфонсо VI (1065–1109 гг.). Не раньше 1077 г. по инициативе Альфонсо VI в Клюни было введено ежедневное литургическое поминовение короля Фернандо I и его супруги Санчи Леонской и раздача милостыни в память о них. Формированию прочных отношений между Клюни и леоно-кастильским королевским домом способствовало освобождение захваченного в плен соперниками Альфонсо VI, которому активно содействовал аббат Гуго I (1072 г.). Согласно Житию Гуго I, аббат, получив известие о поражении, нанесённом Альфонсо братом Санчо, вознёс молитвы за него и повелел монахам молиться об освобождении короля. Одного из клюнийских монахов (Химено, бывшего епископа Бургосского) Гуго направил в Кастилию. После этого тирану Санчо во сне явился апостол Пётр и, угрожая скорой смертью, велел отпустить Альфонсо на свободу. Согласно Хронике монастыря Санта-Мария-ла-Реаль в Нахере (вторая половина XII в.), епископы, аббаты и знатные лица Леонского королевства тщетно просили Санчо освободить брата. Тогда Альфонсо обратился за помощью к аббату Клюни, указывая на то, что монахи заключили с его отцом Фернандо I договор о взаимной поддержке. По молитвам клюнийцев король был освобождён. В 1080 г. Альфонсо VI женился на Констанции, дочери герцога Роберта I Бургундского и племяннице Гуго, аббата Клюни. Между Клюни и королями Леона и Кастилии были установлены особые отношения, которые клюнийцы называли «связь» (coniunctio), а король Альфонсо VI – «союзный договор» (pactum societatis). В 1077 и 1090 гг. были подтверждены (или, скорее, впервые установлены) крупные регулярные выплаты аббатству, что позволило не только увеличить раздачу милостыни, но и начать постройку монастырской церкви (так называемой Клюни III). С 1073 г. Альфонсо VI передавал под контроль Клюни испанские монастыри, которые вошли в Клюнийскую конгрегацию (Сан-Сальвадор-де-Палат-дель-Рей в Леоне, Санта-Мария-ла-Реаль, Сан-Исидро-де-Дуэньяс и др.). Многие из этих обителей находились на паломническом пути из Франции в Сантьяго-де-Компостела. Другие испанские монастыри, не включённые в Клюнийскую конгрегацию, приняли клюнийские «обычаи». Наиболее значимым среди них было аббатство Саагун, имевшее собственную монастырскую филиацию; его возглавил ученик Гуго I Бернард (впоследствии архиепископ Толедский; 1086–1124 гг.). Клюнийцы нередко выступали посредниками между испанскими королями и Римскими папами. При их участии во второй половине XI в. мосарабское богослужение было заменено римским обрядом (см. ст. Испано-мосарабский обряд).