Торжественная месса в честь беатификации Петра Канизия была совершена папой 20 ноября 1864 г. В 1897 г. папа Лев XIII по случаю 300-летия со дня кончины Петра Канизия издал энциклику «Militantis Ecclesiae». В ней, в частности, папа сравнивал современную ему религиозную ситуацию с той, которая была при жизни Петра Канизия, предлагая его в качестве образца католическому духовенству и верующим. В энциклике Пётр Канизий впервые был официально назван «вторым апостолом Германии» («alter Germaniae Apostolus»). Перечисляя заслуги Петра Канизия перед католической церковью, папа особо останавливался на его трудах по организации религиозного образования и призывал современников к подражанию ему. Вскоре после беатификации начался сбор материалов для канонизации Петра Канизия; 20 марта 1921 г. папа Римский Бенедикт XV (1914–1922 гг.) одобрил представленный доклад о чудесах Петра Канизия. 21 мая 1925 г. папа Пий XI одобрил канонизацию Петра Канизия, выпустив особую декреталию (консисторскую буллу) «Misericordiarum Deus», в которой Пётр Канизий официально провозглашался католическим «учителем Церкви» («Doctor Ecclesiae»). В тот же день по случаю канонизации была совершена торжественная месса. 19 сентября 1997 г. в честь 400-летия со дня смерти Петра Канизия папа Римский Иоанн Павел II (1978–2005 гг.) направил немецким епископам апостольское послание «Als der hl. Petrus Canisius», в котором призывал следовать примеру Петра Канизия, прежде всего, в делах образования и воспитания юношества. 9 февраля 2011 г. папа Бенедикт XVI (2005–2013 гг.) в рамках цикла бесед о католических святых Средневековья и Нового времени, произносившихся им в течение года на общих аудиенциях по средам, выступил с речью о Петре Канизии, где отметил, что служение Петра Канизия является образцом для всех христиан. Хотя сохранилось несколько прижизненных изображений Петра Канизия, наиболее точным портретом исследователи признают эстамп, выполненный в 1599 г. гравёром Домиником Кустосом (ум. в 1612 г.), который лёг в основу многочисленных гравюр, появлявшихся в XVII в. В XVII–XIX вв. Петра Канизия часто изображали с книгой (катехизисом): он либо держит её в руках, либо указывает на неё, лежащую открытой на столе. Исследователи встречают изображения Петра Канизия как проповедника, стоящего на кафедре, или как мистика, молитвенно устремляющего взор ввысь. В XX в. Пётр Канизий нередко был представлен в окружении детей, преподающим урок катехизиса. После канонизации Петра Канизия во многих храмах Германии появились его статуи и посвящённые ему алтари; в нескольких городах были установлены памятники и памятные знаки. При беатификации и канонизации Петра Канизия день памяти назначался на 27 апреля, однако в 1969 г. в ходе литургических реформ он был перенесён на день кончины Петра Канизия – 21 декабря. В настоящее время 27 апреля сохранилось в качестве дополнительного дня памяти Петра Канизия в католическом региональном календаре для немецкоговорящих стран («Regionalkalender für das deutsche Sprachgebiet»).