При «великом князе» Борисе Константиновиче он был поставлен в епископы «граду Суждалю, и Нижному Новуграду, и Городеску патреархом Цареградскым». Однако случаи поставления константинопольским патриархом епископов на русские кафедры, кроме Киевской митрополии, исследователям не известны. Борис Константинович никогда не правил в Суздале, в 1355–1383 гг. Суздаль был владением его старшего брата Димитрия (Фомы) Константиновича, который около 1365 г. передал город в качестве удела своему сыну Василию Кирдяпе (владел городом до 1382 г., когда был уведён заложником в Орду). Суздальскими епископами в то время были Даниил (1330–1347, 1351–1363 гг.), затем Алексий (поставлен в 1363 г., скончался в 1364/1365 г. – «Полное собрание русских летописей», том 15, выпуск 1). В 1374 г. на Суздальскую кафедру был поставлен Дионисий. Таким образом, Иоанн, как полагают исследователи, управлял Суздальской епархией в 1365–1373 гг., при этом в его титуле не могли упоминаться Нижний Новгород и Городец, поскольку в 1363 – 1364/1365 гг. митрополит Алексий изъял эти города из-под власти Суздальского епископа Алексия и включил в состав Митрополичьей области (территория епархии в границах Суздальско-Нижегородского княжества была восстановлена в 1374 г.). В Житии Иоанна рассказывается о том, как по желанию князя Бориса Константиновича и по благословению Иоанна преподобный Евфимий основал в Суздале преображенский монастырь. Святитель, преподобный и князь в сопровождении множества людей отправились на поиски подходящего места для обители, по дороге по молитвам Иоанна совершались многочисленные исцеления. При большом стечении народа Иоанн благословил место будущей обители и поставил крест там, где должен был впоследствии стоять церковный престол. Иоанн возвёл Евфимия в сан архимандрита и благословил служить с палицей, в митре и с рипидами. В Житии Иоанна это событие не датировано. По сообщению Жития Евфимия Суздальского, которое послужило в данном сюжете источником Жития Иоанна, монастырь был основан 36-летним Евфимием. Если исходить из того, что преподобный родился в 1316 г. (такая дата указана в пространной редакции Жития преподобного Евфимия – Российская государственная библиотека), то основание Спасо-Евфимиева монастыря, по мнению исследователей, должно быть отнесено к 1352 г. Однако в это время в Суздале правил князь Константин Васильевич (1331/1332 – 1355 гг.), Суздальскую кафедру занимал епископ Даниил, кроме того, основание монастыря в 1352 г. исследователи считают маловероятным, поскольку в этом году суздальские земли пострадали от опустошительной эпидемии чумы. Противоречивые сведения Жития преподобного Евфимия не могут являться препятствием для того, чтобы отнести основание монастыря и пребывание Иоанна на Суздальской кафедре к более позднему времени – 1365–1373 гг. Исследователям представляется маловероятным, чтобы Суздальская кафедра после кончины епископа Алексия в 1364/1365 г. до поставления Дионисия в 1374 г. оставалась вакантной при наличии союзных отношений между Нижегородско-Суздальским князем Димитрием Константиновичем и Владимирским великим князем Дмитрием Ивановичем, которые действовали в полном согласии с митрополитом Алексием.