Исследователи предполагают, что дата 3 июля была выбрана в связи с тем, что под этим числом в Мартирологе Узуарда указана память мученика Иринея, который мог быть отождествлён с Иринеем Лионским. Память Иринея Лионского под 28 июня была внесена Цезарем Баронием в Римский Мартиролог (1583 г.). В римских богослужебных книгах, изданных после литургической реформы папы Пия V, поминовение святого перемещено на 4 июля. В Римском бревиарии (1568 г.) память Иринея Лионского поместили в категорию «pro aliquibus locis» (службы местночтимым святым, имеющим общецерковное значение), при этом праздник получил статус «двойного» (duplex). В 1921 г. память Иринея Лионского под 28 июня была включена в календарь Римского Миссала и, таким образом, получила общецерковное распространение. В связи с реформой Римского Мартиролога (1960 г.) под 28 июня восстановили вигилию праздника апостолов, а поминовение Иринея Лионского (праздник третьего класса) перенесли на 3 июля. Однако с 1969 г. память Иринея Лионского в Мартирологе указывается под 28 июня. Согласно современному календарю Римско-католической церкви, поминовение Иринея Лионского обладает статусом «память» (memoria). Литургическое поминовение Иринея Лионского как Учителя церкви и мученика совершалось во многих епископствах Франции. Так, в Парижском бревиарии 1745 г. и в Дижонском 1821 г. в день памяти Иринея Лионского («duplex minus», под 28 июня) совершалась общая служба мученикам с особыми чтениями (из послания Иринея Лионского к Флорину и из сочинения «Против ересей», а также из творений Иеронима Стридонского и Григория Турского). Упрощённый вариант богослужения засвидетельствован в Бревиарии епископства Пуатье, где предусмотрено только чтение из «Истории франков» Григория Турского. В богослужебных книгах Лионского архиепископства XVIII–XIX вв. поминовение Иринея Лионского указывалось под разными датами. Так, в Лионском миссале 1737 г. память Иринея Лионского (со статусом «двойного» праздника и с октавой) указана под 10 ноября. Согласно Лионскому бревиарию 1815 г., память Иринея Лионского праздновалась в воскресенье после праздника апостолов Петра и Павла (29 июня); со статусом «малое торжество» (solemne-minus). В литургических указаниях Лионского архиепископства 1842 г. память Иринея Лионского значится под 10 июля, в календаре 1868 г. – под 3 июля («двойной» праздник первого класса с октавой). Исследователям известно также о местном праздновании памяти открытия мощей Иринея Лионского (1413 г.), которое совершалось в третье воскресенье после Пасхи. В настоящее время поминовение Иринея Лионского как Учителя церкви и покровителя архиепископства совершается в Лионе 28 июня (в соответствии с календарём местночтимых святых Лионского диоцеза 1982 г.). К V–VI вв. относятся самые ранние сведения о почитании в Лугдуне гробницы Иринея Лионского. Благодаря археологическим раскопкам XIX–XX вв. исследователям известно, что гробница находилась на территории крупного пригородного некрополя, возникшего в I в. н.э. На месте гробницы Иринея Лионского находится церковь со средневековой криптой, которая неоднократно перестраивалась, что затрудняет архитектурные и археологические исследования.