Одним из доказательств владения Иннокентием церковнославянским языком и простой мовой могли быть сведения о его проповедях. Однако таких свидетельств у исследователей нет, кроме единственного упоминания в «Пирамиде» Димитрия Ростовского о том, что Иннокентий до настоятельства в Киево-Печерском монастыре «с кафедры простирал целый невод проповеди слова Божиего о Царствии Божии, а тем ловил людей в смирение и набожность»; став же архимандритом, «не восходил уже на кафедру, не сказывал проповедей» (произнесение проповедей не входило в непосредственные обязанности настоятеля Киево-Печерского монастыря, где существовала должность проповедника). Иннокентий традиционно считается автором первого восточнославянского сочинения по нравственному богословию «Мир с Богом человеку, или Покаяние святое, примиряющее Богови человека, учением, от Писания Святого и от учителей церковных собранным», опубликованного в Киеве в 1669 г. на церковнославянском языке. Содержащееся на титульном листе указание, что книга издана «благословением и исправлением» Иннокентия, позволяет исследователям считать его, по крайней мере, вдохновителем и редактором сочинения. Некоторые исследователи считают, что замысел сочинения принадлежал ещё митрополиту Петру (Могиле), и данный труд необходимо рассматривать в контексте проводившихся святителем Петром церковных преобразований (работы Л. Довги). Учитывая, что обучение в Киево-Могилянской коллегии велось на латыни, а нравственное богословие как самостоятельная дисциплина стало преподаваться систематически лишь в начале XVIII в., исследователи сделали вывод, что сочинение предназначалось не для учебных целей, но было практическим пособием для духовенства. В нескольких письмах Лазарь (Баранович) побуждал печерского архимандрита издать книгу: «Будем раскаиваться, если книга о покаянии не будет издана в свет. Теперь немного учителей в Израиле… Теперь, когда открывается случай… не оставьте воспользоваться им, чтобы предупредить народ от ошибок» (письма от 13 марта 1669 г., 14 октября 1668 г.). Сочинение «Мир с Богом...» состоит из вводной части («Увещания предословная»), включающей два предисловия (одно обращено к царю Алексею Михайловичу, второе – к читателю) и небольшое введение с объяснением основных терминов нравственного богословия, и трёх частей: «О покаянии обще», «О кающемся» и «О служителе тайны святаго покаяния». Основную часть сочинения составляют пространные теоретические и практические наставления, связанные с совершением таинства исповеди, с перечнями основных грехов, которыми нарушаются десять заповедей и главные церковные установления, а также грехов, связанных с различными видами профессиональной деятельности и с сословной принадлежностью.