Конфликт по поводу инвеституры затронул, прежде всего, Германию, где со времён династии Оттонов имело место сращение церкви и государства в форме имперской церкви, и назрела необходимость по-новому определить соотношение «regnum» и «sacerdotium». Смерть Генриха III, правление которого считается расцветом императорской власти, и то обстоятельство, что его малолетний сын не сможет править в прежнем стиле, по сути, уже означали конец периода «единства “regnum” и “sacerdotium”». За время регентства до совершеннолетия Генриха IV (1065 г.) мирские и духовные князья значительно упрочили свои позиции. На фоне ослабления королевской власти инициатива в проведении церковной реформы окончательно переходит к папству. Со смертью Виктора II (1057 г.) пресеклась череда «немецких пап», лояльных императору. Римскую кафедру занимают ставленники радикального крыла реформаторов, руководимого кардиналами Петром Дамиани, Гумбертом, Гильдебрантом (впоследствии папа Григорий VII) и поддерживаемого давними противниками германского императора Салической династии – тосканскими маркграфами. На этом этапе реформы предпринимаются первые, ещё осторожные попытки Рима реализовать новый принцип взаимоотношения католической церкви со светской властью: ограничить влияние императоров на выбор пап и влияние мирян на церковь в целом. Декретом папы Николая II от 1059 г., поводом для которого послужили разногласия между римским духовенством и кардиналами – избрание антипапы Бенедикта X (1058–1059 гг.), император устранялся от участия в выборах папы, теперь это было в компетенции только кардиналов. Тогда же в русле начатой борьбы с симонией впервые прозвучало сформулированное в общих чертах требование установить повсюду свободные канонические выборы прелатов и запретить мирянам назначать клириков на должность. С целью укрепить авторитет Римской кафедры при папе Александре II (1061–1073 гг.) и особенно в первые годы понтификата Григория VII (1073–1085 гг.) усилия Римской курии направлялись на ужесточение церковной дисциплины, притом что Григорий VII использовал обвинение в симонии, чтобы обуздать власть епископов и установить папскую супрематию над клиром в Германии и Италии. Антиреформационные настроения в среде имперского епископата росли, надежды папы на поддержку реформ королём Генрихом IV не оправдались. Генрих IV, с начала правления ставший заложником сложной внутриполитической ситуации, был занят восстановлением отчуждённой за время регентства королевской собственности и укреплением своей власти в многочисленных конфликтах с региональной знатью.