В связи с этим каменную часовню в монастырской стене при игумене Исаакии (1721–1731 гг.) пытались переделать в келью. Указом Синодального казённого приказа от 13 марта 1723 г. был закрыт как самостоятельный приход храм преподобной Марии Египетской (статус храма до этого времени исследователям неизвестен). Его клирики входили в состав братии обители, но вели самостоятельное хозяйство со своей утварью. У Мариинской церкви были свои прихожане, клир этой приходской церкви платил налоги независимо от монастыря. В 1728 г. игумен Исаакий участвовал в коронации императора Петра II Алексеевича. К концу его игуменства, в 1730 г., в обители проживали четыре иеромонаха, два иеродиакона и монах. В 1734 г., при настоятеле (1732–1736 гг.) игумене Евсевии (Левонове), в монастыре числилось семь монахов. 13 мая 1736 г. около десятка неизвестных ворвались в игуменскую келью и, связав игумена Евсевия (Левонова) и келейника, ограбили их. 16 июля игумен Евсевий (Левонов) скончался. В это время в монастыре проживали всего шесть монахов, в основном, преклонного возраста, а также четыре солдата, выделенные для охраны монастырского имущества. В 1737 г. во время сильного пожара в Москве обгорели кровли Мариинской и Никольской церквей, в последней пострадал иконостас, сгорели игуменская и 15 братских келий, выгорели каменные конюшня и тёплая трапезная. При отсутствии в то время в монастыре игумена с доношением о тяжёлом положении в контору Сената 26 сентября 1737 г. обратился старейший насельник обители – иеромонах Иаков. Архитектор Иван Фёдорович Мичурин, которому было поручено осмотреть постройки, пострадавшие от пожара, составил опись утрат и подсчитал, что на восстановление требуется около 1305 руб., но таких средств у обители не было. В 1739 г., при настоятеле (1738–1742 гг.) игумене Петре (Котляревском), в Московском Сретенском монастыре было четыре престола, проживали три иеромонаха. Утром 11 марта 1739 г. воры проникли в собор и сорвали драгоценные украшения с трёх Владимирских икон Божьей Матери. В ответ на обращение игумена о назначении караула 6 июня были выделены два отставных солдата для охраны сретенской ризницы. Восстановление после пожара 1737 г. началось только в 1740 г. В 1742 г. игумен самовольно продал две пострадавшие от пожара монастырские палаты на кирпич, за что 28 июня того же года был отстранён от настоятельства. Его сменил игумен Софроний (Зиминский; 1742–1744 гг.), после которого управлять монастырём был назначен игумен Лаврентий (Уваров; 1744–1757 гг.), бывший член Пекинской духовной миссии. При нём положение Московского Сретенского монастыря улучшилось. К 1745 г. были заново отстроены Никольская церковь с трапезной, настоятельский двор, вместо прежнего шатра колокольня приобрела барочный вид, в 1745 г. заново отлит большой колокол весом 195 пудов. В 1751 г. по инициативе игумена Лаврентия (Уварова) была подтверждена сохранность мощей преподобной Марии Египетской. С игуменом Лаврентием (Уваровым) связано и начало установки в монастыре деревянного резного так называемого Шумаевского креста, выполненного Григорием Семёновичем Шумаевым, плавильщиком монетного двора. Кроме игумена Лаврентия (Уварова) в Московском Сретенском монастыре проживали девять монахов и причётников.