Постепенно в Нижнем Новгороде сложился кружок любителей истории, ведущую роль в котором играл П.И. Мельников, вскоре ставший редактором неофициальной части «Нижегородских губернских ведомостей». Только в 1848–1849 гг. на страницах этого издания Макарий опубликовал двадцать статей, преимущественно биографического характера, о бывших иерархах Нижегородской епархии. Деятельное участие принял Макарий и в работе Нижегородской временной комиссии по разбору древних актов, учреждённой в мае 1849 г. по распоряжению императора Николая I. Члены комиссии занялись тщательным обследованием архивов присутственных мест губернии, монастырей и храмов. Были найдены великокняжеские, царские и патриаршие грамоты, начиная с периода удельного Нижегородско-Суздальского княжества и до середины XVIII в., а также ряд ценнейших столбцов уездных судов городов Арзамаса и Балахны. В 1849 г. Макарий был избран действительным членом Императорского Русского географического общества (РГО). С 1848 по 1891 гг. в распоряжение общества было передано 160 корреспонденций из Нижегородской губернии, из них за 1860–1890 гг. только 18, т.е. около 11% всего материала. Основная часть хранившихся в архиве РГО документов по Нижегородской губернии датируется 1840–1850 гг. Наиболее интенсивные работы по сбору документов проводились в 1849 и 1850 гг. Количество присланных за 1849 г. материалов составило 34 ед. хр., из них шесть принадлежали самому Макарию. В распоряжение общества из Нижегородской губернии были направлены 46 корреспонденций, из которых 10 вышли из-под пера Макария. Макарий обладал выдающимися организаторскими способностями. Во многом ориентируясь на программы РГО по собиранию этнографических материалов, составил целую программу для сбора исторических сведений. Документ с одобрения архиепископа Нижегородского и Арзамасского Иакова (Вечеркова) был разослан по всем приходам и церквам, о чём сообщалось в приписке к одной из рукописей Макария, хранящихся в РГО. Сельское духовенство Нижегородской губернии неукоснительно приняло к исполнению распоряжение архиерея, активно включилось в процесс «народознания». Архив располагает примерно сорока ответами. Текст программы не обнаружен, но, судя по содержанию ответов, она включала в себя, по мнению исследователей, вопросы по местоположению села, о его владельцах, храме и его истории, местных достопримечательностях. Исследователи полагают, что к программе предлагалось приложить и план селения, что многие составители и сделали. Макарий установил связи с научными обществами и учёными России, посылал статьи по истории и археологии Нижегородской губернии в Императорское Русское археологическое общество. Патриотически настроенное руководство общества стремилось осуществить грандиозный проект по исследованию отечественных древностей. В 1850 г. этнограф и археолог Иван Петрович Сахаров призвал провинциальных сотрудников общества принять участие в копировании надписей на древних памятниках: «Общество надеется, что сельские священники, настоятели монастырей и помещики, как более знакомые с местными древностями, примут участие в общем деле».