Отсутствие имени Клавдия II в перечнях епископов Везонциона исследователи объясняли тем, что в агиографической традиции произошло смешение двух епископов. Пьер-Франсуа Шиффле предположил, что Клавдий принадлежал к знатному римскому роду Клавдиев, которые, по его мнению, жили в Салене во времена Меровингов. Некий Клавдий был майордомом короля Бургундии Теодориха II (595–613 гг.). Согласно Пьеру-Франсуа Шиффле, майордом Клавдий, резиденция которого находилась в замке Бракон, был отцом святого. Соглашаясь с произвольными выводами Пьера-Франсуа Шиффле, историки XIX в. высказывали также необоснованные предположения о деталях биографии Клавдия и о датировке событий его жизни. Эти гипотезы свидетельствуют о доверии к сведениям Жития Клавдия, в котором, однако, по мнению исследователей, содержатся анахронизмы. В описаниях жизни соборных каноников и деятельности Клавдия на епископской кафедре присутствуют косвенные указания на реформу, осуществлённую в Безансоне архиепископом Гуго I из Салена (1031–1066). Согласно Житию, избрание епископа и аббата требовало санкции Папского престола, но утверждение папой Римским результатов выборов в архиепископстве Безансон и в аббатстве Сен-Уайан-де-Жу стало актуальным только после схизмы XII в. В этот период архиепископскую кафедру в Безансоне занимал Герберт (1163–1170 гг.), ставленник императора Фридриха I Барбароссы, на стороне императора выступал также Адон II, настоятель аббатства Сент-Уайан-де-Жу, смещённый за это папскими легатами. Таким образом, Житие Клавдия исследователи не могут рассматривать как достоверный источник сведений о событиях VI–VII вв. В настоящее время большинство исследователей придерживаются гипотезы Бернара де Врежия, согласно которой Клавдий стал аббатом монастыря Кондат между 648 и 657 гг. и скончался между 703 и 713 гг. Клавдий занимал должность настоятеля при короле Хлодвиге II и при папе Римском Иоанне, скорее всего, Иоанне V (685–686 гг.) или Иоанне VI (701–705 гг.). К 698 или 699 г. исследователи относят соглашение о десятине, которое он заключил с епископом Вульфином. На протяжении семи лет Клавдий исполнял обязанности монастырского епископа. Существование в монастыре Кондат должности епископа без определённой кафедры было обусловлено значением обители, большим  количеством братии, обширными земельными владениями и удалённостью монастыря, расположенного в гористой области Юра, от городов, в которых существовали епископские кафедры. В Хронике монастыря Сен-Уайан-де-Жу упоминается, что кроме Клавдия епископский сан носили аббаты Ипполит и Ритберт. Аббат Ипполит присутствовал на Соборе в Аттиньи (762 г.), под актами которого подписался как «епископ из монастыря Евгенда». Авторы XII в. не понимали, что речь шла о монастырских епископах, поэтому в «Хронике» Клавдий был назван архиепископом Безансона, а Ипполит – епископом Белле. Таким оюразом, смешение этого Клавдия с Клавдием, епископом Везонциона, который жил в VI в., основано на неверном толковании записи из перечня настоятелей монастыря Кондат: «Клавдий, епископ 7 лет и аббат 55 лет». В XII в. составитель «Хроники», знакомый с перечнем епископов Везонциона, отождествил этого Клавдия с епископом Клавдием. Это послужило отправной точкой развития агиографической легенды о Клавдии.