В 1809 г. на отвоёванных у Порты землях Буджакской Орды и Бессарабской райи была образована Заднестровская область (Восточная Бессарабия); её разделили на пять цинутов (округов): Бендерский, Аккерманский, Кагульский, Ренийский и Измаильский. Все татары из Буджака были переведены в местность Молочные Воды (современная Запорожская область, Украина). На место опустевших татарских аулов в 1809–1810 гг. были поселены свыше 2 тыс. болгар, около 1 тыс. армян, представители задунайских казачьих формирований: казаки-запорожцы (жили за Дунаем с 1781 г.) и казаки-некрасовцы. 20 декабря 1809 г. митрополит Гавриил (Банулеску-Бодони) ходатайствовал о рукоположении ему в викарного епископа для Южной Бессарабии румынского уроженца иеромонаха Мефодия, префекта Киевской духовной академии. Однако Синод остановился на другой кандидатуре. 16 июня 1811 г. в помощь митрополиту Гавриилу (Банулеску-Бодони) был хиротонисан викарный епископ Бендерский и Аккерманский Димитрий (Сулима). До 11 декабря 1811 г. епископ жил в Голийском монастыре, затем переехал в Кишинёв. 16 мая 1812 г. между Оттоманской Портой и Россией был подписан Бухарестский мирный договор, по которому Порта уступила России Заднестровскую область с крепостями Бендеры, Измаил, Хотин, Килия и Аккерман; русские войска были выведены с молдавских земель за Прутом. 6 августа 1812 г. митрополит Гавриил (Банулеску-Бодони) обратился к командующему русской Дунайской армией адмиралу Павлу Васильевичу Чичагову с донесением, в котором сообщил о своём отъезде из Ясс (город остался в Оттоманской Порте) и указал, что «для архиерейской кафедры приличнее других мест г. Кишинёв» (раньше в Кишинёве жил протопоп Лопушнянского цинута, в Лопушне находился его наместник). Для организации в Кишинёве центра Молдавского экзархата митрополит Гавриил (Банулеску-Бодони) просил предоставить ему в качестве кафедрального Михаило-Архангельский собор, «преклонённый» к Иерусалимскому патриархату, а приписанный к афонскому Зографскому монастырю монастырь Кэприана обратить в загородный архиерейский дом. Эти просьбы были выполнены с учётом согласия Иерусалимского патриарха Поликарпа передать эту обитель в дар императору Александру I, о чём предстоятель Иерусалимской церкви сообщил в письме от 26 октября 1814 г. обер-прокурору Святейшего Синода князю Александру Николаевичу Голицыну (Российский государственный исторический архив). 24 сентября 1812 г. митрополит Гавриил (Банулеску-Бодони) прибыл в Кишинёв, вместе с ним переехала экзаршеская консистория, разместившаяся первоначально в доме кишинёвского мещанина Сабова. Здание при кафедральном Михаило-Архангельском храме было отведено для нужд жившего в Молдавии греческого Иерапольского епископа Григория и викария Молдо-Влахийского экзархата епископа Димитрия (Сулимы). Тогда же загородным имением митрополичьего дома стал монастырь Кэприана, перешедший в ведение митрополита Гавриила (Банулеску-Бодони) вместе с монастырскими владениями Пуркары и Раскайцы в Аккерманском уезде. 10 ноября 1812 г. митрополит Гавриил (Банулеску-Бодони) сообщил в Синод, что в его ведении состояло 749 церквей в 755 селениях Бессарабии.