В конце 1660 гг. – 1672 г. в отсутствие митрополичьего местоблюстителя Лазаря (Барановича), который находился в Новгороде-Северском, игумен Феодосий ведал от его имени церковными делами в Киеве. В 1672 г. вместе с архимандритом Иннокентием (Гизелем) он просил царя Алексея Михайловича о защите Киева от военной угрозы со стороны турецких войск. В 1679 г., во время Русско-турецкой войны, Киев был вновь укреплён: новый земляной вал насыпали от Золотых ворот до южного угла территории Киевского Златоверхого монастыря. В начале XVII в. Киевский Златоверхий монастырь владел в Киеве почти всей южной частью Старого города, Дворцовой частью вдоль Крещатика и так называемой Введенской нивой. На окраине города, за Пробитым валом, находилось имение Кудрявцы с монастырскими пашнями. Рядом с городом, на Ориновской земле и на Девич-горе, обитель владела около 75 десятинами земли и мельницей. Киевскому Златоверхому монастырю принадлежали богатые рыбной ловлей и сенокосом острова на Днепре Церковный, Обрубной и озёра с реке Половицей, лесные владения Селивонщина, Золоктаевская земля в Толстом лесу, Лысковщина, имения Глевацкое (Глеваха), Ветянское (Вета, ныне Вита-Почтовая) и Юровка, Борщаговка. В 1654 г. активную поддержку Киевскому Златоверхому монастырю оказывал гетман Богдан Михайлович Хмельницкий, который пожаловал братии богатые имения в Левобережной Украине, в том числе село Выгуровщина, со «ставами, сеножатми, озёрами, полями и иншими всеми акциденциями», запретив казакам, чтобы «жебы в жадные наименьше провента не встручали ане жадными шинками не бывали» (к концу XVII в. монастырь значительно увеличил имение Выгуровщина, скупив соседние участки земли). Но оставшиеся в Правобережной Украине на территории Речи Посполитой владения Киевского Златоверхого монастыря  после заключения Андрусовского перемирия в 1667 г. постепенно были отданы польской шляхте. К концу XVII в. в собственности обители находилось около 70 дворов в Глевахе, два двора на хуторе Вета, 25 дворов в Соколовке, Даниловке и Драновке, шесть дворов в Юровке, пять дворов в Борщаговке, 18 дворов в Жерновке, 16 дворов в Заборье; в окрестностях Киева – сёла Даниловка, Крюковщина, Заборье, Княжичи, Блиставица, мельница на реке Красной. В 1708 г. епископ Переяславский Захария (Корнилович) основал Онуфриевский Даниловский Липянский (Липлянский) скит на землях Даниловки и Заборья. К монастырю была приписана и Красногорская Троицкая пустынь. Во второй половине XVII – начале XVIII вв. крупные земельные приобретения экономически укрепили положение обители. Гетманы не только подтверждали прежние владения, но и дарили Киевскому Златоверхому монастырю новые земли. Так, гетман Иван Ильич Скоропадский передал монастырю сёла Боденьки и Крехаев на реке Десне. Здесь же Киевский Златоверхий монастыр приобрёл мельницу, двор с пекарней и «винницей». На пожертвования монастырь купил мельницу в Переяславе, 11 дворов с полями, озерами, двумя мельницами в городе Остре. Среди щедрых благотворительниц упоминается Мария Гамалия, в начале XVIII в. завещавшая село Хрули (ныне Лохвицкого района Полтавской области) с 25 крестьянами, двумя мельницами на реке Суле, «дворцом», «винницею», хуторами Ведкаловка и Деркаловка, лесами и садами. Её сын Иван пожаловал монастырю село Бодавка.