Несмотря на то что армяне держали в руках политическую власть и составляли большинство, они продолжали считать себя переселенцами, некоренными жителями страны. Поэтому Григор III до конца жизни стремился вернуть престол католикосата на территорию Великой Армении, в бывшую столицу Багратидов Ани, и заключил договор об этом с мусульманским правителем этого города Абу-ль-Асваром. Торос II женился на дочери крестоносца Симеона, правителя Рабана, что должно было укрепить связи Рубенидов с «франками». Усилению Киликийской Армении продолжали препятствовать армянские княжеские дома региона, сохранившие провизантийскую ориентацию: Хетумиды, Айказуни и Натанаелиды. Граф Жослен II, правитель Эдессы, уже не принадлежавшей крестоносцам в 1144–1146 гг., и его вассалы считали Тороса II своим союзником. Их общим врагом был Иконийский султанат, который занял ряд областей и основные крепости Горной Киликии, а в Приевфратье угрожал захватом города Мараш. Усиление Икония не было выгодно также атабеку Халеба Нур ад-Дину, который в 1148 г. заключил союз с Жосленом II. В 1149 г. Нур ад-Дин нанёс решительное поражение антиохийскому войску в битве при Инабе, в то время как другие христианские правители, в том числе Киликийской Армении, не смогли поддержать Антиохию. Византия же всеми способами стремилась удержать Киликийскую Армению в числе своих вассалов и препятствовала её самостоятельной политике. Для укрепления власти Торосу II необходимо было прибегнуть к военным действиям. В 1151–1152 гг. он наносил удары византийским армиям дук Киликии Фомы и Андроника Комнина, взял в плен несколько армянских правителей Киликии, придерживавшихся провизантийской политики. Наибольшим авторитетом пользовался князь Ламброна Ошин Хетумид. Большинство местных князей Киликии были вынуждены заплатить выкуп и стать вассалами Тороса II. В 1153 г. Византия спровоцировала нападение Иконийского султаната на Киликийскую Армению. Сельджукское войско вторглось в страну, но Торос II смог избежать крупного военного столкновения путём переговоров. Тем временем в Киликии продолжалось некое двоевластие: с одной стороны, Торос II получал византийские титулы, но с другой – из Константинополя в Киликию параллельно назначались лояльные к Византии правители. В 1154–1156 гг. император Мануил I Комнин продолжал попытки сломить Тороса II, настраивая против него то Иконий, то Антиохию. Тем не менее, влияние Византии в регионе падало. Местные правители гораздо быстрее договаривались друг с другом, чем на это могло реагировать далёкое константинопольское правительство. В 1156 г. князья Киликийской Армении и Антиохии предприняли поход на Кипр, чем вынудили византийского императора Мануила I вновь попытаться силой переломить ситуацию в регионе в свою пользу. В 1158 г. император Мануил I вторгся в Киликию. Князь Торос II с войском сначала удалился в горы, но затем вместе с князем Антиохии присоединился к союзу против Халеба, созданному Мануилом. Торос II признал вассальную зависимость от Византии, передал ей ряд ранее захваченных владений, освободил пленных союзников Византии. Тем самым Киликийская Армения была избавлена от разграбления. Войска Тороса II участвовали в походе византийцев против Халеба, который закончился безрезультатно.