Самый ранний иконный памятник календарного типа с сохранившимся образом святого – так называемый Синайский гексаптих (вторая половина XI – первая половина XII в., пинакотека монастыря великомученицы Екатерины на Синае). В лицевых рукописных минологиях святой изображён на миниатюре в Минологии на год с циклами двунадесятых праздников и Жития великомученика Димитрия Солунского (1327–1340 гг., Фессалоника) и в греко-грузинской рукописи (так называемой Афонской книге образцов – Российская национальная библиотека, конец XV в.) – на обеих миниатюрах в рост. В ряде храмов, декорация которых построена на минейном принципе, представлена сцена мученичества Иустина Философа. В нартексе церкви Сорока мучеников в Велико-Тырнове, Болгария (около 1230 г.) изображён сюжет отравления Иустина Философа философом Крискентом, основанный на сообщении Евсевия Кесарийского: Иустин Философ – средовек с тёмными взлохмаченными волосами стоит на коленях, связанный, перед своим мучителем Крискентом, который вливает из сосуда в горло мученику яд. Сцена усекновения главы представлена в церкви великомученика Георгия в Старо-Нагоричино, Македония (1317–1318 гг.; вместе с мучеником Харитоном) и в церкви Святой Троицы монастыря Козия, Румыния (около 1386 г.). Образ Иустина Философа включён в настенные минологии в церкви Успения Богородицы монастыря Грачаница, Косово и Метохия (около 1320 г.; три полуфигуры святых, из которых идентифицированы Иустин Философ и мученик Харитон) и церкви Успения монастыря Трескавец близ Прилепа, Македония (между 1334 и 1343 гг.) – в рост, в правой руке крест, левая отведена в сторону, у святого остроконечная, достаточно длинная борода, на шею повязан белый плат. В русских минеях один из ранних примеров изображения Иустина Философа представлен на годовой минее первой половины XVI в. (Музей икон, Рекклингхаузен) – тёмноволосый средовек с короткими до ушей волосами и округлой средней длины бородой, облачён в сине-зелёный хитон и красный плащ, в правой руке держит крест, левая прижата к груди. Так же он изображается и на других иконах, нередко в паре с Дионисием Глушицким, память которого приходится на тот же день: на иконах на май из комплекта годовых миней XVI в. (Вологодский музей-заповедник), конца XVI в. (Краснодарский музей-заповедник; на шее белый, орнаментированный по краю плат), XVIII в., работы И.Ф. Липина (Краснодарский музей-заповедник); на иконе на май и июнь XVII в. (старообрядческая реставрация первой четверти XIX в., Русский музей); на гравированных святцах работы Григория Павловича Тепчегорского (1714 и 1722 гг. издания; в правой руке – развёрнутый свиток) и И.К. Любецкого (1730 г.). Несколько икон современного письма с образом Иустина Философа связаны с освящением во имя этого святого храмового престола. Так, в церкви в Джэксонвилле, Флорида (Православная Церковь в Америке), иконы Иустина Философа находятся в алтарной преграде и на аналое.