Глинская пустынь содержала несколько гостиниц, богаделен, странноприимниц, в том числе в самой обители, в деревне Заруцкой, на подворье при Сеймских мельницах. Посетителей Глинской пустыни обеспечивали бесплатным питанием, жильём, одеждой. Значительные средства Глинская пустынь жертвовала пострадавшим от стихийных бедствий, на устроение храмов военно-врачебных заведений, на содержание православного миссионерского общества, в пользу Иерусалимской церкви Гроба Господня, на русских паломников в Палестине, и устройства храмов в Туркестанском крае. Обитель оказывала помощь пострадавшим от землетрясений на острове Закинф (Занте), жителям Греции, Балкан. Глинская пустынь известна своей издательской и просветительской деятельностью, начало которой положил игумен Филарет. Помимо наставлений монашествующим и уставов он вёл обширнейшую переписку (в год писал более 750 писем), составлял нотные книги. В журнале «Странник» печатались духовно-назидательные книги глинского иеромонаха Порфирия (Левашова, ум. в 1868 г.): «О воспитании девиц в духе истинно христианском», «Взгляд на монашество», «О причинах раскола», «Беседа со старообрядцами», «О бессмертии». Игумен Иасон известен как составитель жизнеописаний глинских старцев: схиархимандрита Илиодора, монаха Феодота, монаха Мартирия, схимонаха Евфимия, монаха Досифея и др., вошедших в многотомное издание «Жизнеописания отечественных подвижников благочестия 18 и 19 веков». С конца XIX в. обитель издавала духовно-просветительскую литературу, в 1901–1910 гг. – Жития старцев Глинской пустыни, а также бесплатные «Глинские листки», «Глинские Богородицкие книжки», которые поступали в школьные библиотеки. В 1908 г. при Глинской пустыни был открыт миссионерский кружок во имя апостола Иоанна Богослова для борьбы с сектантством. В 1812 г. братия Глинской пустыни пожертвовала значительные средства на вещи для русского войска. В период Крымской войны (1853–1856 гг.) по инициативе игумена Евстратия Глинская пустынь оказывала материальную и пастырскую помощь дружине Курского ополчения в Путивльском уезде. Во время Русско-турецкой войны (1877–1878 гг.) в Глинской пустыни был устроен большой лазарет для раненых воинов, в основном, гвардейских полков, которых содержали за счёт обители. За лечение воинов настоятель игумен Иннокентий и братия получили благодарность покровительницы общества Красного Креста императрицы Марии Александровны. В 1914 г., во время Первой мировой войны, в Глинской пустыни был устроен лазарет. Медикаменты, кровати, бельё были заготовлены на средства обители. Ухаживали за ранеными солдатами монахи под руководством опытного инока-фельдшера. При обители был устроен санаторий для воинов, нуждавшихся в отдыхе после лечения, а также приют для детей погибших (на 15 мальчиков).