В январе 1505 г. Томас Мор вступил в брак с Джейн Колт (ум. в 1511 г.), происходившей из семьи эсквайра в графстве Эссекс. В браке родились четыре ребёнка: Маргарет (1505 г.), Элизабет (1506 г.), Сесиль (1507 г.), Джон (1509 г.). Вскоре после смерти первой супруги Томас Мор женился на богатой вдове Элис Миддлтон (ум. в 1546 или 1551 г.); её дочь от первого брака Томас Мор воспитывал как собственную. У пары не было общих детей, однако, по свидетельствам самого Томаса Мора, Элис Миддлтон оказалась хорошей мачехой его детям. Кроме детей Томаса Мора и приёмной дочери в его семье воспитывались также сирота Энн Кресакр (1511–1577 гг.), которая впоследствии вышла замуж за его сына, и дальняя родственница Томаса Мора Маргарет Гиггс (1508–1570 гг.). Свои педагогические идеи Томас Мор успешно реализовывал, обучая родных и приёмных детей. Он считал женщин способными к научной деятельности и хотел, чтобы его дочери получили такое же высшее образование, как и его сын (эти взгляды были нетипичными для того времени). Несмотря на предельную занятость, Томас Мор всегда находил время для молитв и домашней школы, где давал детям классическое и христианское образование. Занятия древними языками и литературой сочетались с обучением географии, математике, музыке, астрономии, медицине. Наиболее близкие отношения сложились у Томаса Мора со старшей дочерью Маргарет, в замужестве Роупер (ум. в 1544 г.), которая была весьма талантлива, проявляла значительные литературные способности. Так, она стала первой в Англии женщиной не королевского происхождения, опубликовавшей под собственным именем перевод с латыни на английский язык; для перевода было избрано одно из сочинений Эразма Роттердамского – «О Молитве Господней» («Precatio Dominica»). Именно Маргарет Роупер адресовано значительное число сохранившихся писем Томаса Мора; особую важность для исследователей имеет их переписка, относящаяся к периоду предсмертного заключения Томаса Мора в Тауэре. До 1524 г. семья Томаса Мора жила в собственном доме «Олд-Бардж» на ул. Баклерсбери, относившемся к приходу Сент-Стивен-Уолбрук; затем Томас Мор переехал в построенный по его плану большой дом в Челси, архитектурный дизайн которого с галереями, часовней и библиотекой нёс явный отпечаток его философии, любви к учёным занятиям и уединённым молитвам.