В 1830–1840 гг. многие католические обители в Могилёвском католическом архиепископстве были упразднены, главным образом, за поддержку Польского восстания 1830–1831 гг. В связи с причастностью к восстанию преподавателей был закрыт Виленский университет (1832 г.). Главная семинария и богословский факультет были объединены; на их базе образована Римско-католическая духовная академия. В 1840 гг. она была переведена в Санкт-Петербург (Императорская Римско-католическая духовная академия действовала до 1918 г.). В 1846 г. в Могилёвском католическом архиепископстве (без подчинённых диоцезов) насчитывалось десять монастырей, 288 приходов, 592 тыс. католиков. Из подчинённых Могилёвскому архиепископу-митрополиту епископств крупнейшим было Виленское католическое епископство (41 монастырь и 318 приходов). В Тельшевском католическом епископстве насчитывалось девять монастырей и 119 приходов, в Луцко-Житомирском католическом епископстве – 18 монастырей и 113 приходов, в Каменецком католическом епископстве – пять монастырей и 106 приходов, в Минском католическом епископстве – 23 монастыря и 94 прихода. Всего в пределах Могилёвской церковной провинции насчитывалось больше 2,7 млн. католиков, 1038 приходов и 106 монастырей (72 мужских и 34 женских). 3 августа 1847 г. был заключён конкордат между Российской империей и Папским престолом. Буллой «Universalis Ecclesiae cura» от 3 июля 1848 г. утверждались оговорённое в конкордате создание Херсонского епископства (с 1852 г. – Тираспольское епископство, хотя с 1856 г. центром епархии был Саратов), включавшего южные земли Могилёвского католического архиепископства, и Каменецкого епископства с викариатами (суффраганатами) в Саратове и Тифлисе, и деление католических приходов Российской империи на две церковные провинции: Варшавскую (для Царства Польского) и Могилёвскую (для остальных частей Российской империи). В составе Могилёвской церковной провинции (митрополии) были учреждены семь католических диоцезов: Могилёвское католическое архиепископство, епископства Виленское, Тельшевско-Самогитское (Жямайтское), Минское, Луцко-Житомирское, Каменецкое и новообразованное Херсонское. Папским посланием от 2 августа 1848 г. «Ubi inscrutabile» Могилёвскому архиепископу Казимиру Дмоховскому (1848–1851 гг.) поручалось окормление армянских католических приходов в Каменецком и Херсонском епископствах (объединяло армяно-католиков Бессарабии, Северного Причерноморья, Крыма, Северного Кавказа и Закавказья) до назначения для них отдельного епископа, при этом параллельно сохранялись должности администраторов армяно-католических приходов Подолии и Закавказья, подчинявшихся архиепископу Могилёвскому. В связи с Польским восстанием 1863–1864 гг. правительство предприняло усилия по замещению польского языка, использовавшегося в католических проповедях и ином внелитургическом служении, русским языком. 25 декабря 1869 г. император Александр II (1855–1881 гг.) распорядился употреблять русский язык наряду с латынью в католических храмах. После Польского восстания были закрыты многие католические обители в западных губерниях Российской империи.