Такой принцип организации католических структур в империи объяснялся как длительной традицией подобного деления, так и физической невозможностью одному пастырю управлять столь обширными территориями. Папский престол указывал на противоречие императорского указа от 14 (25 н. с.) декабря 1772 г. о создании католического диоцеза на территории Российской империи каноническому праву католической церкви: «Регламент 1769 г.» фактически отрицал верховную власть папы Римского и право Папского престола быть единственной апелляционной инстанцией для всех католиков. Станислав Богуш-Сестренцевич предложил создать при епископе коллегию и передать ей функции Юстиц-коллегии. Он считал необходимым установить непосредственные сношения с Папским престолом и обеспечить свободное объявление в Российской империи папских булл и бреве. Эти требования были отвергнуты Екатериной II. 5 (16 н.с.) ноября 1773 г. Станислав Богуш-Сестренцевич представил императрице новый проект, в котором согласился с созданием католического диоцеза в границах Российской империи. Место будущей епископской резиденции он предложил определить в центре Белорусского генерал-губернаторства – Могилёве. Епископ настаивал на необходимости канонического утверждения Белорусской епархии Папским престолом, отмены контроля Юстиц-коллегии в делах католической церкви и права на непосредственные контакты с Римом. Хотя этот проект также был отклонён, 22 ноября (3 декабря н.с.) 1773 г. императрица Екатерина II издала указ об учреждении Белорусской католической епархии с кафедрой в Могилёве и назначила на неё епископа Станислава Богуша-Сестренцевича. Несмотря на то, что декретом Конгрегации пропаганды веры от 5 марта 1774 г. за Станиславом Богушем-Сестренцевичем были признаны права епископа (ординария), управлявшего всеми католиками латинского обряда в Российской империи, папа Римский отказался признать за ним титул епископа Белорусского, пожалованный императрицей без согласования с Папским престолом. На изменение позиции Рима повлияла политика Екатерины II по отношению к униатам: после того как униатская Полоцкая кафедра, глава которой окормлял греко-католиков на восточно-белорусских землях, стала вакантной (Иасон Смогоржевский, Полоцкий униатский архиепископ (1762–1780 гг.), в 1780 г. стал униатским Киевским митрополитом), императрица указом от 2 (12 н.с.) июля 1780 г. распорядилась для управления греко-католиками создать особую консисторию из трёх человек и возобновить политику обращения униатов в православие. На просьбу папы Римского Пия VI (1775–1799 гг.) поставить архиепископа в Полоцк императрица ответила требованием возвести Станислава Богуша-Сестренцевича в достоинство архиепископа и наделить его паллием. Указом от 17 (28 н.с.) января 1782 г. императрица Екатерина II самовольно учредила Могилёвское католическое архиепископство в границах всей Российской империи, назначив главой архиепископства Станислава Богуша-Сестренцевича (он был освобождён из юрисдикции Юстиц-коллегии и напрямую подчинён Сенату). После напряжённых дипломатических переговоров папа Пий VI буллой «Onerosa pastoralis officii cura» от 15 апреля 1783 г. подтвердил полномочия архиепископа и дал согласие на создание в России Могилёвского католического архиепископства.