22 августа 1920 г. по предложению патриарха во внимание к 50-летним трудам на Алтае Макарию был пожизненно присвоен титул митрополита Алтайского. «Тоскую по Алтаю, – писал Макарий в сентябре 1919 г., – хотя и там теперь не то, что было. И там началось разрушение. Никаких вестей оттуда не получаем, как из могилы». Он принимал у себя своих духовных чад, церковных деятелей. Несколько раз в Николо-Угрешском монастыре его посещал патриарх Тихон, в 1925 г. приезжал патриарший местоблюститель Крутицкий митрополит Пёр (Полянский), которому Макарий подарил свой белый клобук. Постоянными посетителями Макария были Серпуховский епископ Арсений (Жадановский), который оставил о нём воспоминания, и известный московский пастырь Сергий Мечёв. Большим утешением для Макария стал переезд в Николо-Угрешский монастырь Бийского архиепископа Иннокентия (Соколова; ум. в 1937 г.), прослужившего в Алтайской миссии 53 года. Выпущенный из московской Бутырской тюрьмы без права выезда далеко от Москвы, он поселился в Угрешском монастыре, став постоянным собеседником митрополита, его помощником на богослужениях и в управлении делами Миссии. В Угрешу приехала и чемальская игуменья Людмила. Вместе они иногда совершали службы на алтайском языке. «Алтай, дорогой, родной Алтай!» – говорил нередко старец. Из Николо-Угрешского монастыря Макарий управлял алтайской паствой и делами Миссии: рассматривал бумаги, хиротонисал епископов. «Надо было видеть, с каким чувством возлагал он свои святительские руки на головы хиротонисуемых для Сибири епископов: Ник., Серг., Хрис. – чтобы понять всю любовь и привязанность его к своему, ничем не заменимому Алтаю!». Остаток своей жизни Макарий желал провести на дорогой его сердцу Алтайской земле. Но Григорий Иванович Чорес-Гуркин (1870–1937 гг.), председатель сформировавшейся в революционные годы Алтайской Горной думы, выступил за недопущение Макария на Алтай, и старец остался в Угреше. Оставаясь в Николо-Угрешском монастыре, Макарий вёл аскетичную монашескую жизнь, проводя дни в трудах и молитве. Вставал он рано и до обедни работал. Никогда не пропускал службы в домовой церкви, в которой ежедневно служили всенощную и обедню. Парализованный, он сидел в кресле, которое завозили в алтарь. 16 мая 1924 г. состоялась первая после освобождения из-под ареста поездка патриарха Тихона в Николо-Угрешский монастырь.