В северо-восточном углу монастырского комплекса размещена игуменская резиденция с парекклисионом мученицы Наталии, построенным генеральным консулом Греции в Александрии А. Маносом (1873 г.). В корпусах также устроены парекклисионы св. бессребреников Космы и Дамиана, Всех святых, св. Иоанна Предтечи, святителя Спиридона Тримифунтского. Слева от входа в монастырь находится кафизма Николая Чудотворца (1799 г.), которая используется как усыпальница. Она построена на месте, где раньше существовала византийская обитель Макри. Старый кладбищенский храм св. Архангелов с фресками второй половины XVII в. расположен на вершине лесистого холма к северо-западу от монастыря. Пристань Кутлумуша находится на восточном берегу полуострова Айон-Орос, в местности Калиагра, между монастырями Ивирон и Ставроникита. Она защищена пятиэтажной башней. До постройки в конце XIX в. пристани в Дафни к ней причаливали корабли с путешествующими в Карею. Кутлумушу принадлежат скит великомученика Пантелеимона, расположенный к востоку, по пути к Иверскому монастырю (основан в 1785 г., кириакон 1790 г., фрески 1866 г.), 18 келлий и четыре исихастирия на Капсале. Кутлумуш – единственный из афонских монастырей, не имеющий своего конака-представительства в Карее, поскольку расположен в нескольких минутах ходьбы от неё. В конце XIX – начале XX вв. двве келлии Кутлумуша, великомученицы Варвары и Николая Чудотворца, были заселены русскими иноками, а келлия великомучеников Феодора Тирона и Феодора Стратилата, приобретённая в 1895 г. российским подданным схимонахом Иоакимом (Барканеску), – молдавскими. В Кутлумуше хранятся частица Честного и Животворящего Креста Господня, стопа праведного Анны, челюсть священномученика Иерофея, левая рука Григория Богослова, честная глава преподобного Алипия Столпника, а также частицы мощей апостола Павла, мученика Тимофея, великомученика Пантелеимона, новомученика Панагиота Кесарийского, преподобного Нила Мироточивого, мученика Кирика, великомученика Иакова Персянина, мученика Трифона, Василия Великого, священномученика Харалампия, св. Параскевы и преподобной Матроны Пергийской. Помимо иконы «Грозное Предстательство» в Кутлумуше чтут образы Божьей Матери Алтарницы, или Комниной (типа Дексиократуса, т.е. с Младенцем на правой руке), XVIII в., и Божьей Матери «тис Стиларинис», или Ятриссы (т.е. Целительницы), XIV в. (перевезена с подворья Кутлумуша на острове Мармара). Библиотека серьёзно пострадала от пожаров. Кроме того, не всегда книги хранились в надлежащих условиях. В.Г. Григорович-Барский застал библеотеку в большом небрежении («безчинна и вовся небреженна»), из-за чего многие рукописные книги и грамоты сгнили. В архиве находятся 47 документов византийского периода (1012–1447 гг., главным образом, XIV в.), в библиотеке – 662 рукописи, из которых 100 написаны на пергамене. Как свидетельствует ктиторская надпись игумена Максима над центральным входом в наос, в 1540 г. были расписаны кафоликон в честь Преображения Господня, его наос, лити и экзонартекс. Свою подпись автор росписей, монаха Макарий, поместил на одеяниях великомученика Димитрия Солунского в южной певнице.