Здесь хранились также частицы от Гроба Господня, часть древа Креста Господня. Чудотворной считалась храмовая икона Сергия Радонежского в серебряной вызолоченной ризе, изготовленной в 1892 г. в память 500-летия преставления преподобного. Икону украшал оклад 1632 г., устроенный старцем строителем Малахией (Ржевитиным) «по себе и своих родителях». Сохранилась одна из святынь Киржачского монастыря – Владимирская икона Божьей Матери (XV в., Исторический музей), которую к 1917 г. украшал серебряный оклад (Государственный архив Владимирской области). Из древних образов исследователи отмечают находившуюся в Спасской церкви местную икону Спасителя с преподобными Сергием и Никоном (1659 г.) работы иконописца Симона Ушакова; Нерукотворный образ Спасителя (1548/1549 г.) – вклад старца Паисия из Благовещенского собора. Почитаемой была храмовая икона «Происхождение честных древ Животворящего Креста Господня» с 20 праздничными клеймами в серебряном позолоченном окладе из Спасской церкви. Реликвиями Киржачского монастыря были деревянный посох с железным наконечником, принадлежавший настоятелям, хоругвь с образами равноапостольных Константина и Елены, вышитыми по малиновому бархату золотом и серебром в медном позолоченном круге с сиянием, – вклад 1635 г. новоспасского архимандрита Иосифа «по родителях своих в вечной поминок». В октябре 1917 г. началось разорение городских церквей. В 1918 г. строения и всё имущество бывшего монастыря и Всехсвятская церковь были реквизированы властями военного ведомства, хотя в том же году Киржачский УИК передал в пользование общине верующих наиболее ценное имущество, хранившееся в церквах. Оно было взято на учёт Главмузеем Наркомпроса РСФСР, до 1923 г. часть его хранилась в опечатанном Спасском храме, другая была вывезена в Троице-Сергиеву лавру. Весной 1922 г. под предлогом помощи голодающим Поволжья было проведено изъятие из храмов предметов для богослужения из серебра и золота, за исключением тех, которые состояли на учёте Главнауки. Были вскрыты два захоронения в усыпальнице Милославских, но ценностей там не обнаружили. 23 мая 1923 г. Киржачская ликвидационная комиссия закрыла Благовещенский, Спасский и Сергиевский храмы, но поскольку здания и находившееся в них имущество были «историческими по своей древности», они вместе с часовней преподобного Романа были переданы в ведение Главмузея. Благодаря энтузиазму местного учителя Н.В. Синичкина на территории бывшего монастыря организовали Киржачский церковно-бытовой музей, впоследствии филиал Владимирского государственного музея.