Арабское мусульманское большинство относится к христианам настороженно; радикальные исламские политики своими выступлениями неоднократно провоцировали погромы арабов-христиан. Выход из ситуации многие христиане видят лишь в эмиграции, которая особенно усилилась в течение последних 30 лет, в основном в США, Канаду и Австралию. К началу XXI в. в США находились два монастыря и 15 приходов ИПЦ, образованных иммигрантами из Палестины. В 2002 г. ИПЦ организовала свою эпитропию в США, которую возглавил архиепископ Яффы Дамаскин, однако в 2008 г. приходы ИПЦ в Америке были переданы в юрисдикцию Константинопольской православной церкви. Ныне ИПЦ состоит из двух митрополий и одной архиепископии, владеет 23 храмами, 23 мужскими и 5 женскими монастырями. Самым большим и богатым является монастырь Святого Гроба (в нём около 200 монахов); среди остальных лишь женские монастыри имеют постоянные общины. Большинство монастырей таких общин не имеют, в них чаще всего размещены подворья и странноприимные дома для паломников. На территории монастыря, принадлежащего братству «Гроба Господня», куда принимаются только греки (т.к. рядовых монахов здесь готовят к священническому служению, а священниками могут быть преимущественно греки) располагается много церквей и других зданий. Здесь находятся и главные христианские святыни (Голгофа, Гроб Господень, храм Воскресения, настоятелем которого обязательно является представитель ИПЦ), и резиденция патриарха. При патриархе существует Синод, в состав которого входят почти все архиереи и некоторое число архимандритов. Количество членов Синода не должно превышать 18 человек. Священный Синод во главе с патриархом управляет всем патриархатом. Члены Синода являются представителями духовенства и назначаются лично патриархом. Есть ещё и смешанный Собор, позволяющий мирянам принимать участие в деятельности патриархата. Определены и требования, которым должен отвечать кандидат в патриархи: иметь иорданское подданство, быть не моложе 40 лет, являться православным монахом в сане епископа или архимандрита Иерусалимского патриархата, хорошо знать арабский язык. Чаще всего патриархи избираются из членов Святогробского братства. Процедура его выборов со временем претерпела изменения. Прежде список кандидатов посылался на рассмотрение турецкому правительству; возвращался он, как правило, в усечённом виде. Из оставленных в списке кандидатов члены Синода тайным голосованием выбирали патриарха, который после этого утверждался Портой. То же было и при иорданском правительстве. Неугодных ему кандидатов вычёркивал король. Ныне представители духовенства и мирян избирают трёх кандидатов в патриархи. Из них члены Синода выбирают главу церкви, и новый патриарх утверждается королём Иордании. Сам акт избрания патриарха довольно прост, но зато очень торжественно происходит его интронизация. В самом Иерусалиме насчитывается около 8 тыс. православных верующих, а общая численность приверженцев ИПЦ составляет 130 тыс. человек. Под её юрисдикцией находится Синайская архиепископия, центром которой является монастырь св. великомученицы Екатерины на Синайском полуострове. Настоятель монастыря имеет епископский сан и носит титул «Архиепископ Синайский и Раифский». Архиепископ имеет подворья в Египте, Турции, Ливане, Греции, на острове Кипр.