Общая исповедь Иоанна Кронштадтского производила неизгладимое впечатление на современников: «Сначала батюшка прочёл молитвы перед исповедью. Затем сказал несколько слов о покаянии и громко, на весь собор, крикнул: “Кайтесь!” Тут стало твориться что-то невероятное. Вопли, крики, устное исповедание тайных грехов. Некоторые стремились – особенно женщины – кричать как можно громче, чтобы батюшка услышал и помолился за них. А батюшка в это время преклонил колена пред Престолом, положил голову на Престол и молился. Постепенно крики превратились в плач и рыдание. Продолжалось так минут 15». Вскоре опыт общей исповеди Иоанна Кронштадтского оказался востребован. Так, весной 1905 г. в Японии священник Сергий Судзуки просил благословения на совершение общей исповеди по причине слишком большого числа желавших исповедаться. Начальник Духовной миссии в Японии Николай (Касатки) разрешил о. Сергию совершать общую исповедь. Исследователям известны многочисленные случаи чудотворений и исцелений по молитвам Иоанна Кронштадтского. Сам пастырь свидетельствовал о них. Приглашённый своим духовным сыном епископом Сарапульским Михеем (Алексеевым) 21 июля 1904 г. Иоанн Кронштадтский в беседе с собравшимися священниками подробно объяснил, как начал молиться об исцелении просящих помощи: «Кто-то в Кронштадте заболел. …Я стал молиться, предавая болящего в руки Божии, прося у Господа исполнения над болящим Его Святой воли. Но неожиданно приходит ко мне одна старушка... и настойчиво требует от меня, чтобы я молился о болящем не иначе, как о его выздоровлении. ...Тогда я исповедал пред Господом своё ничтожество и свою греховность, увидел волю Божию во всём этом деле и стал просить для болящего исцеления. И Господь послал ему милость Свою – он выздоровел. ...В другой раз по моей молитве исцеление повторилось. Я тогда в этих двух случаях прямо усмотрел волю Божию, новое себе послушание от Бога – молиться за всех, кто будет этого просить. И теперь я и сам знаю, и другие передают, что исцеления по моей молитве совершаются». Упомянутая Иоанном Кронштадтским «старушка», Параскева Ивановна Ковригина, в 1872 г. поселилась в Кронштадте по благословению духовника, иеромонаха Илариона (Решминского), ученика Серафима Саровского. Именно она «открыла» Иоанна Кронштадтского для Санкт-Петербурга, стала рекомендовать нуждающимся обращаться к нему за помощью. В 1886 г. П.И. Ковригина была похоронена на Троицком кладбище в Кронштадте; на отпевании Иоанн Кронштадтский произнёс проповедь. Позже по инициативе пастыря на её могиле была построена часовня (к 2010 г. восстановлена). По молитвам Иоанна Кронштадтского выздоравливали безнадёжно больные, не только те, которые встречались с пастырем, но и те, о ком он молился заочно. Иоанн Кронштадтский не благословлял отказываться от медицинского лечения, но призывал, прежде всего, прибегать к исповеди и причастию. Начало всероссийской известности чудотворений Иоанна Кронштадтского положило благодарственное заявление, опубликованное 20 декабря 1883 г. в газете «Новое время». 16 человек, объяснявшие своё исцеление молитвами Иоанна Кронштадтского, описывали свои болезни, изъявляли ему благодарность и передавали «спасительный завет» пастыря – как можно чаще приступать к Святому Причастию.