Для решения судебных тяжб с участием гугенотов при действующих парламентах создавались чрезвычайные палаты (палаты эдикта), чьи полномочия сводились к рассмотрению гражданских и криминальных дел и к контролю за исполнением эдикта. Новые палаты состояли наполовину из гугенотов. Самой большой была палата эдикта при Парижском парламенте: один президент из католиков и 16 советников (десять от католиков и шесть от гугенотов). Католичество оставалось государственной религией, но были подтверждены права гугенотов на свободу проповеди, школьного преподавания и богослужения. Реформатское богослужение по-прежнему было запрещено в Париже, во всех крупных городах и епископских резиденциях, но разрешалось там, где было введено раньше (два места в каждом бальяже и сенешальстве в окрестностях городов, всего около 200 городов). Центрами гугенотов стали Шарантон, Сомюр, Монтобан, Седан (в Сомюре, Монтобане и Седане были основаны кальвинистские семинарии). Деятельность консисторий, коллоквиумов, провинциальных и национальных синодов разрешалась только с санкции короля. В отличие от выпущенных ранее мирных эдиктов дополнительным бреве предусматривалась материальная поддержка гугенотских министров (пасторов) – 45 тыс. экю ежегодно из доходов королевской казны. В основной части эдикта король разрешал гугенотам самим заботиться о вспомоществовании министров, кроме того, допускалась поддержка протестантских церквей частными лицами. Самой серьёзной уступкой, сделанной гугенотам, было сохранение за ними военных крепостей и городов на юге и юго-западе Франции. Кроме того, несмотря на запрет протестантских богослужений при королевском дворе, герцогам, пэрам, маркизам, графам, губернаторам, генеральным наместникам, маршалам и капитанам охраны короля разрешалось совершать протестантские богослужения в кругу семьи, без громкого пения псалмов. Однако подчёркивалось, что если король пребывает более трёх дней в местах, где разрешено отправление протестантского культа, то богослужение может быть совершено только после его отъезда. После длительного противостояния Парижского парламента эдикт был зарегистрирован 25 февраля 1599 г. В сентябре 1599 г. эдикт прошёл регистрацию в Парламенте Гренобля, 12 января 1600 г. – в Парламенте Дижона, а 19 января – Тулузы. В августе 1600 г. эдикт утвердили Парламенты Экса (современный Экс-ан-Прованс) и Рена, и только в 1609 г. – Парламент Руана. У гугенотов вызывали недовольство нарушения в реализации эдикта, они требовали ввести запрет на перекрещивание детей, осудить Сорбонну за отказ предоставлять гугенотам учёные степени, выступали против обязательного соблюдения католических праздников и проч. Собрания гугенотов защищали свой статус посредников в отношениях между монархом и реформатскими церквами: они претендовали на полномочия по контролю за соблюдением эдикта, за поступлением денег на поддержку министров и военных гарнизонов, призванных обеспечивать безопасность гугенотов.