Несмотря на запрет, результатом отмены Нантского эдикта стала массовая эмиграция (за 1660 гг. около 400 тыс. протестантов) в Англию, Нидерланды (в Утрехте им предоставлялись права городских граждан и освобождение от налогов на 12 лет), Германию, Данию, Швецию, Южную Африку и Америку, где они проживают по сей день. Французские поселения были основаны в Нью-Йорке, Массачусетсе, Вирджинии и в Северной и Южной Каролине. В России по указу 1688 г., подписанному царями Петром Алексеевичем (1689–1725 гг.) и Иоанном Алексеевичем (1613–1645 гг.), гугеноты-офицеры принимались на службу в русскую армию. В Англии король Карл II (1660–1685 гг.) издал прокламацию (28 июля 1681 г.), в которой предлагал гугенотам убежище и обещал предоставить им право натурализации и льготы в ведении торговых и промышленных дел. Эти обещания были впоследствии подтверждены королём Яковом I Стюартом (1603–1625 гг.). Оставшиеся во Франции гугеноты перешли на нелегальное положение, совершали тайные богослужения, пасторы, захваченные при свершении обрядов, приговаривались к колесованию. В 1702 г. насильственные меры со стороны администрации и католического духовенства против гугенотов после отмены Нантского эдикта и увеличение налогов ввиду войны за испанское наследство (1701–1714 гг.) стали причинами восстания камизаров в Лангедоке (Южная Франция). Центром движения были Севенны, где гугеноты во главе с Жаном Кавалье, Роланом (Пьером Лапортом) и др. занимали деревни и города, жгли католические церкви, дома духовенства, замки, отнимали у откупщиков и сборщиков собранные ими церковную десятину и налоги. Основными требованиями были свобода вероисповедания и отмена налогов. В 1703–1704 гг. восстание распространилось на области Виваре, Веле, Руэрг и Оранж. Папа Климент XI (1700–1721 гг.) провозгласил Крестовый поход против камизаров. В начале 1703 г. в Лангедок были направлены королевские войска (во главе с маршалом Н.О. де Лабомом, маркизом де Монревелем). Неудачи правительственных войск вынудили французское правительство подписать в мае 1704 г. соглашение, по которому кальвинистам Лангедока была обещана свобода богослужения. Осенью 1704 г. основные силы восставших были разбиты, но усмирить восстание удалось лишь к весне 1705 г. путём уступок по налоговым вопросам. Вспышки восстания продолжались до 1715 г. (особенно сильно в 1709 г. в Севеннах и Виваре). В ноябре 1787 г. король Людовик XVI (1774–1793 гг.)  издал эдикт веротерпимости, которым восстанавливались гражданские свободы гугенотов, признавалась регистрация протестантских рождений, браков и смертей, а также запрещалось преследовать протестантов по причине их веры. При Наполеоне I Бонапарте (1804–1814, 1815 гг.) гугеноты были уравнены в правах с католиками, протестантским церквам предоставлялись субсидии и устанавливался государственный контроль (закон 18 жерминаля X г.; 1802 г.).