В 1763 г. епископ Георгий (Конисский) от имени всех православных Польши подал челобитную императрице. 27 июля 1765 г. произнёс речь перед королём Станиславом Августом Понятовским о тяжёлом положении православных и всех некатоликов-«диссидентов» в Польше, позже подал королю «Мемориал об обидах православным». Архиерей собирал древние королевские грамоты, составил реестр храмов, отобранных у православных; на базе этих материалов издал книгу «Права и вольности исповедующих греко-восточную веру в Польше и Литве» (Варшава, 1767 г.; на польском языке). Епископ Георгий (Конисский) участвовал в создании в марте 1767 г. Слуцкой конфедерации – объединения неримо-католической шляхты с целью защиты неримо-католиков. Результатом появления Слуцкой конфедерации явилось равенство в правах униатов, православных и протестантов с римо-католиками, утверждённое в феврале 1768 г. сеймом Речи Посполитой («Вечный трактат»). После первого раздела Польско-Литовского государства (1772 г.) и вхождения Могилёва в состав Российской империи Могилёвская епархия в 1774 г. была причислена ко второму классу и определена в границах следующих провинций Белоруссии: Могилёвской, Мстиславской, Оршанской и Рогачёвской (современная Витебская, Гомельская и Могилёвская области). С 1780 г. шло воссоединение с православием белорусских униатских приходов. Рескриптом императрицы Екатерины II от 2 июля 1780 г. наместнику Белоруссии Захару Григорьевичу Чернышёву было предписано в случае вакансии священнического места в униатском приходе спрашивать прихожан, не желают ли они иметь православного священника, и, если они изъявляли согласие, предоставлять местным православным архиереям принимать такие приходы в заведование. 7 июля 1781 г. епископ Георгий (Конисский) сообщил в Синод, что к православной церкви в 1780–1781 гг. присоединились 66 церквей с ктиторами, 35 священников и 54 дьячка, более 85 тыс. мирян. В 1782 г. присоединилось 17 церквей, в 1783 г. – 12 приходов. В 1784–1794 гг. присоединение униатов не происходило. В 1795 г., после третьего раздела Польши, северные белорусские области (Витебскую, Полоцкую и Двинскую, которые в 1772 г. были отнесены к Псковской епархии) присоединили к Могилёвской епархии. В 1795 г. Могилёвская и Белорусская кафедра в связи с учреждением на белорусских землях Минской епархии была переименована в Могилёвскую и Полоцкую, территория Борисовского уезда отошла Минской епархии. Дело воссоединения белорусских униатов получило новый импульс: в 1795 г. к православию присоединилось 105 церквей и 34 священника, 120 тыс. мирян. В 1802 г. кафедральный штат и архиерейский дом были переведены из бывшего кафедрального Преображенского собора в Могилёве в Иосифовский собор (возведён в 1799 г.). Преображенский храм стал приходским, а затем церковью Могилёвской духовной семинарии (1884 г.). В 1812 г., после занятия Могилёва французскими войсками, часть православных клириков во главе с архиепископом Варлаамом (Шишицким) присягнули на верность Наполеону, за что впоследствии архиепископ Варлаам (Шишицкий) был лишён сана. В 1828 г. по инициативе епископа Павла (Морева-Павлова) было упразднено могилёвское Богоявленское братство, т.к. его деятельность сочли не соответствующей церковным правилам.