Наиболее масштабными были мероприятия в Иркутске, Якутске, Петропавловске-Камчатском и Москве. К юбилею было приурочено учреждение новых наград РПЦ – ордена и медали во имя святителя Иннокентия, митрополита Московского и Коломенского, вручаемых за миссионерские заслуги. Фонд народов Севера и портретная галерея «Скрижали Камчатки» учредили премию «Просветитель» имени Иннокентия. В Благовещенске был установлен памятник Иннокентию. В 1997–2005 гг. был построен храм святителя Иннокентия в Бескудникове (Москва; освящён 15 сентября 2005 г.). В 2007 г. на родине Иннокентия, в селе Анга, открылся дом-музей святителя, там же был заложен храм во имя святителя Иннокентия. В 2009 г. по сохранившимся чертежам восстанавливался сгоревший в результате пожара дом Иннокентия в Черкизове (Москва), где находилась его загородная резиденция. Сохранением наследия Иннокентия и памятных мест, связанных с его именем в Москве и других городах России, занимались, в частности, историко-просветительное общество «Русская Америка», Центр североамериканских исследований Института всеобщей истории Российской Академии Наук, а также архимандрит Иннокентий (Просвирнин). 1997 год был объявлен годом Иннокентия в Православной Церкви в Америке, а также в штате Аляска, юбилей отмечался под эгидой ЮНЕСКО. В отреставрированной на деньги Правительства США церкви архангела Михаила в Ситке (Новоархангельске) создан историко-культурный заповедник – Дом русского епископа, в честь Иннокентия названа вершина Алеутского хребта на Аляске (2507 м) – вулкан Вениаминова. Сохранились несколько фотографий, живописных портретов, ряд гравюр и литографий с изображением Иннокентия, относящихся, в основном, к последнему периоду его жизни. Исключение в этом ряду – небольшой по размеру и камерный по характеру портрет Иннокентия 1840 гг. (Киево-Печерский музей-заповедник; в 1878 г. передан в Церковно-археологический музей Киевской духовной академии в составе собрания Андрея Николаевича Муравьёва), где он изображён сравнительно молодым, в бытность епископом Камчатским (существует эстамп аналогичного извода). Святитель представлен по пояс, в кресле, в небольшом повороте влево, в чёрном клобуке и рясе, на груди панагия с Казанским образом Божьей Матери. У него небольшая борода и спадающие на плечи тёмные волосы, взгляд устремлён вверх, в левой руке с чётками на запястье развёрнутый свиток с текстом: «Оудивилъ Г(оспо)дь м(и)л(ос)ть свою на мне Бл(а)гослови дше мо Г(оспо)да и не забывай всхъ возданiи Его».