В 1923 г. – начале 1924 г. епархией, как полагают исследователи, управляли Аксайские епископы Митрофан (Гринёв), затем Захария (Лобов). В 1922 г. ВЦУ назначило на Донскую кафедру обновленческого «архиепископа» Мелхиседека (Николина), в 1923 г. Донскую обновленческую кафедру занимал «архиепископ» Андрей (Одинцов), в 1924–1927 гг. – «архиепископ» Модест (Никитин), носивший титул «Владикавказский, Донской и Новочеркасский» (в 1925 г. – «Верхнедонской»). В 1922 г. обновленческий комитет Царицынской епархии учредил Усть-Медведицкое викариатство, на эту кафедру был «рукоположён» Тихон (Русинов). В 1924 г. Тихон (Русинов) принёс покаяние патриарху Тихону (Белавину) и был хиротонисан во епископа Усть-Медведицкого, викария Донской и Новочеркасской епархии. К началу 1925 г. во главе Донской и Новочеркасской епархии стоял митрополит Митрофан с викарными епископами Иннокентием (Бусыгиным) Каменским и Тихоном Усть-Медведицким. В 1925 г. они присоединились к григорианскому расколу, их подписи стоят под посланием григорианского Временного высшего церковного совета от 22 декабря 1925 г. Митрополит Митрофан и епископ Иннокентий до конца жизни оставались в григорианском расколе, епископ Тихон в 1926 г. принёс покаяние Заместителю Патриаршего Местоблюстителя митрополиту Сергию (Страгородскому), в том же году снова присоединился к раскольникам, в 1931 г. вторично принёс покаяние, но в Донскую и Новочеркасскую епархию больше не возвращался. После смерти митрополита Митрофана григорианскую Донскую кафедру около 1930 г. возглавил епископ Иннокентий. В начале 1930 гг. (до 1932 г.) григорианским Новочеркасским архиепископом был назначен Фотий (Топиро). В конце 1925 г. в связи с уклонением митрополита Митрофана в раскол на Донскую кафедру был, по некоторым свидетельствам, назначен епископ Димитрий (Добросердов), но из-за ареста в епархию не прибыл. В следующем году епископом Усть-Медведицким, викарием Донской епархии, с правом управления епархией стал Иов (Рогожин). В начале 1927 г. архиерей был арестован и приговорён к ссылке. Весной 1928 г. митрополит Сергий назначил на Донскую кафедру епископа Амфилохия (Скворцова), но власти запретили ему въезд в Новочеркасск, и епископ Амфилохий получил назначение на Мелекесское викариатство Самарской епархии. 27 апреля 1928 г. епископом Аксайским стал Серафим (Протопопов), 27 июня того же года он был переведён на Сызранскую кафедру. С 12 марта 1929 г. по 1930 г. Донскую кафедру занимал епископ Антоний (Романовский). Как полагают исследователи, архиерей жил не в Новочеркасске, а в городе Шахты, где он и был арестован (затем до 1932 г. епархия не имела правящих или викарных архиереев).