На Соборе были оглашены и обсуждены письма Вигилия к Юстиниану и Феодоре, произнесённое им осуждение против Рустика и Севастиана, письма его епископам Валентиниану Скифскому и Аврелиану Арльскому, клятвенное обещание, данное им императору, что он будет содействовать осуждению «Трёх глав», сакру императора Юстина I от 7 августа 520 г., где говорилось о бывшей в то время демонстрации в Кире в честь Феодорита, когда его изображение на колеснице ввезли с пением в город, а епископ Кирский Сергий устроил «собрание» в память Феодорита, Диодора, Феодорита и Нестория. Император просил рассмотреть образ действия Вигилия, и Собор признал его заслуживающим низложения и постановил исключить имя Вигилия из диптихов, учитывая, что папа отказался председательствовать на Соборе, не согласился с его постановлениями. План Юстиниана состоял в том, чтобы соборным определением сломить упорство папы и заставить его согласиться на осуждение «Трёх глав». Осуждение «Трёх глав» было принято на Востоке без сильных протестов, но западные прямо заявили, что Пятый Вселенский собор состоялся во вред и уничтожение Халкидонского собора (не согласные с решением Собора были подвергнуты ссылке). Соборные отцы приняли компромиссный Символ веры и лишили Вигилия права на римский престол. Изгнание и преследования поколебали решимость Вигилия. Он выразил готовность подчиниться и 8 декабря 553 г. написал послание к Евтихию, в котором отказался от своих мнений. Но усердие папы дошло до крайности: 23 февраля он издал послание к западным епископам с целью убедить их, что осуждение «Трёх глав» законно. Он даже ухитряется сказать, что враги приписали Иве очень много лишнего, что само послание Ивы к Марию Персу подложно (при таких толкованиях Вигилия нетрудно было согласиться с постановлениями Пятого Вселенского собора). Папа добился своего: лично подписав решения осудившего его Собора, он получил разрешение возвратиться. Вигилий был уже на обратном пути в Рим, но умер в Сиракузах на пути в Рим. Говорят, что он был отравлен своим преемником – папой Пелагием I (556–561 гг.). Эдикт Юстиниана I о «Трёх главах» был обнародован без обсуждения его с епископатом, поэтому был отвергнут почти всеми западными епископами. Однако на осуждение западные епископы долго не соглашались и ссылались на папу Вигилия, хотя эта ссылка не имела достаточного основания, т.к. папа всё-таки дал своё согласие на осуждение «Трёх глав». В его понтификат император Юстиниан I издал закон, на основе которого избрание папы Римского должно было каждый раз утверждаться императором после получения им соответствующей платы. Памятником жизни и деятельности Вигилия остались 18 его посланий (изданы в Париже, 1642 г.), в которых речь идёт о «Трех главах» и монофизитской ереси. См. также ПАПА РИМСКИЙ