В 2 км к югу от современного города Керкира сохранились руины пятинефной базилики мученицы Керкиры (называемой также базиликой Иовиана по имени построившего её епископа) с выступающим трансептом, одной полукруглой апсидой и двумя нартексами. Она была воздвигнута в середине V в. и перестроена в XII в. в однонефный храм. С XV в. это здание было собором монастыря Пресвятой Богородицы Анафонитрии. Фрагменты напольных мозаик из этой базилики, выполненные мастером Елпидием, хранятся в музее Старой крепости. Собор монастыря великомученика Феодора Тирона – трёхнефная базилика с нартексом, сложенная из фрагментов близлежащего дорического храма Артемиды-Горгоны (северный неф разрушен ещё в византийский период), исследователи также датируют V в. Между XVI и XVIII вв. здание перестраивалось, по меньшей мере, два раза. В окрестностях селения Оксьяс (Озьяс) на острове Пакси были обнаружены раннехристианские базилики великомученицы Марины и первомученика Стефана. На Керкире в Ангелокастро на месте трёхнефной базилики V–VI вв. был построен византийский храм архангела Михаила. Около 1000 г. была построена крестово-купольная церковь апостолов Иасона и Сосипатра, служившая монастырским собором. Купол с восточной стороны опирается на стены, отделяющие алтарь от жертвенника и диаконника, а с западной стороны – на две колонны. Центральная апсида трёхгранная, а боковые – полукруглые. Как и в раннехристианских храмах, нартекс отделён от центрального нефа трёхпролётной аркадой на колоннах. Нижняя часть здания сложена из больших блоков туфа, взятых из построек античного города, а верхняя часть – из камней, обрамлённых плинфой. Грани восьмиугольного барабана украшены колонками. В декорации фасадов и апсид использованы кирпичные орнаменты. Сохранились фрагменты росписей относящиеся ко второй половине XI в. (в нартексе – изображения Арсения Керкирского, св. воина на коне (великомученика Георгия или великомученика Димитрия), ангелов (из композиции «Крещение Господне»), ко второй – третьей четверти XII в. (в конхе жертвенника – шесть фронтальных фигур святителей), к первой половине XIV в. (в западном конце жертвенника – две частично утраченные фигуры святителей), к XV в. (в нартексе – Деисус, Николай Чудотворец и мученица Параскева Иконийская). В саркофагах по обеим сторонам царских врат, по преданию, хранятся мощи апостолов Иасона и Сосипатра. В храме также была похоронена Екатерина Дзаккариа, жена последнего морейского деспота Фомы Палеолога. Приблизительно в 17 км к северо-западу от города Керкира, близ деревни Айос-Маркос, находится однонефная церковь великомученика Меркурия, созданная в 1074/1075 г. друнгарием Николаем и его братом Евгением. В ктиторской надписи говорится, что церковь была посвящена пророку Илии и великомученику Меркурию, чем исследователи объясняют наличие в одном нефе двух апсид. В северной апсиде изображены пророки Илия и Елисей, в южной – св. воин (видимо, великомученик Меркурий) и Василий Великий. В верхней части восточной стены помещены медальон с изображением Христа, символы евангелистов и два серафима. На этой фреске впервые символы евангелистов сопровождаются идентифицирующими надписями. Северная и южная стены разделены на две зоны, в нижней расположены ростовые фигуры, в верхней – погрудные образы святых.