Первый двор имеет Г-образную форму. В западном корпусе размещены кельи и парекклисион священномученика Харалампия, над которым устроен синодикон, в северном четырёхэтажном корпусе, разделяющем внешний и внутренний дворы, находятся кельи и подсобные помещения, в южном – кельи, в юго-восточном углу на втором этаже – библиотека, в северо-восточном – трапезная, в юго-западном – вход в здание музея, пристроенное в 1990 гг. к каре монастырских корпусов с запада. Фасады корпусов оформлены галереями с аркадами, которые на кипрском диалекте называются лондзами. Галереи расписаны фресками, представляющими историю основания Киккского монастыря и чудеса от Киккской иконы Божьей Матери (художники братья М. и Г. Морошаны из Румынии, 1989 г.). Мозаики выполнены в 1991–1993 гг. греческими (П. Сарфатис, С. Яннудис с помощниками К. Балдзакисом и А. Яннудисом) и кипрскими (братья Г. и А. Кеполасы) мастерами. Первый двор соединён арочным проходом с внутренним, который имеет форму неправильной трапеции, и расположен на более низком уровне. В восточном корпусе на первом этаже находятся кельи, на втором – резиденция игумена, в западном корпусе на первом этаже размещён церковный магазин, с северной стороны – монастырский собор. В юго-западном углу двора возвышается колокольня (1882 г.); самый большой из шести колоколов (весом 1280 кг) был подарен жительницей Москвы Е. Абрамовой. Собор Киккского монастыря представляет собой трёхнефную однокупольную базилику. Центральный престол освящён во имя Пресвятой Богородицы, правый – во имя Всех святых, левый – во имя архангелов Михаила и Гавриила. В 1973–1974 гг. стены кафоликона были надстроены для установки новой крыши. Снаружи стены укрепили новой кладкой из местного необработанного камня с вкраплением черепицы. Центральный неф перекрыт цилиндрическим сводом, боковые – крестовыми. Уровень вимы на 17 см выше уровня пола наоса. Из диаконника лестница ведёт в небольшое подземное помещение, которое, по мнению исследователей, использовалось как костница, над ним находится небольшая комната. Собор имеет два входа с южной стороны, вход с портиком с северной и ещё одну дверь в северной стене, ведущую в жертвенник. К западу от северного входа в храм пристроены баптистерий и келья. В 2011 г. в них была устроена ризница, где выставлены для поклонения ковчеги с частицами мощей многих святых. От росписей, выполненных известным критским живописцем Иоаннисом Корнаросом (1745–1812 гг.), сохранились только фрески в алтаре. Современные росписи принадлежат кипрскому иконописцу Г. Георгиу (1975–1984 гг.). Иконостас изготовлен в 1755 г. (20х5 м) и включает иконы XVI–XIX вв. Его центральная часть выше, чем боковые крылья. Деисус в центре иконостаса отсутствует. В 1822 г. пострадавший от пожара 1813 г. иконостас был отреставрирован архитектором Хаджи-Константином, сыном Хаджи-Николаса, из Каймакли. Чудотворная Киккская икона Божьей Матери помещена в местный ряд иконостаса третьей слева от царских врат. Она вставлена в проскинитарий, сделанный в 1996 г. Не считая этого образа, написание которого предание приписывает апостолу Луке, древнейшие иконы иконостаса исследователи датируют началом XVI в.: «Святой Иоанн Предтеча», «Апостол Иоанн Богослов» и «Святитель Иоанн Златоуст» в местном ряду, «Святитель Василий Великий» на южной стене, рядом с иконостасом, образа́ апостольского ряда, который есть только в крыльях иконостаса боковых приделов.