В 1851 г. ученик Илариона Грузина Макарий принял блаженную кончину, а Савва был рукоположён во диакона, затем во иерея. Сохранилось письмо иеромонаха Саввы монаху Денасию, подвизавшемуся в Русике, где он описывает, с какой глубокой тревогой отреагировал Иларион Грузин на известие о начале Крымской войны 1853–1856 гг. Узнав, что Константинопольский патриарх Анфим VI (Иоаннидис) издал указ о прочтении во всех афонских монастырях молитвы о даровании победы туркам, старец «ужаснулся и сказал: “Он не христианин!”». По предсказанию Илариона Грузина, читавшие молитву монахи монастыря Григориат (см. Григория преподобного монастырь на Афоне) навлекли на себя гнев Божий: водяной поток снёс мельницу, в обители поднялся ропот. Игумен и братия умоляли Илариона Грузина указать им, как испросить прощение Божье, и следовали всем его наставлениям. По сведениям архимандрита Херувима (Карамбеласа), в 1854 г. офицеры русского парусника, бросившего якорь у Дионисиата, по приказу российского императора Николая I обратились к Илариону Грузину, чтобы узнать исход войны. Старец, не желавший, чтобы его почитали пророком, отказывался, но на третий день, уступив уговорам, сказал: «Россия перенесёт трудности, она не победит, но и территорий не потеряет». В 1857 г. в Дионисиате возник конфликт в связи с тем, что в просфорне жил просфорник, содержавший котов. Иларион Грузин обвинил настоятеля монастыря Евлогия в небрежении к святому и посоветовал выстроить для просфорни более просторное помещение – «хотя бы в половину» новой кельи настоятеля. Разгневанный игумен заставил старца покинуть монастырь, и Иларион Грузин перебрался в группу калив Малой св. Анны, находившуюся близ пещеры, где он раньше подвизался. Некий купец приобрёл для него принадлежавшую скиту кафизму преподобного Онуфрия, в которой Иларион Грузин прожил пять лет. Алтарь келлии нуждался в значительном ремонте, но в скиту средств для этого не было. Деньги появились чудесным образом: один монах из Великой Лавры, занятый сбором средств для своей обители, встретил в Валахии некую женщину, которая вручила ему 20 червонцев и просила передать Илариону Грузину. Как выяснилось позже, старец не знал, кто она, и, решив, что деньги не для него, велел раздать нищим. Однако совет Лавры определил использовать эти средства на перестройку церкви в келлии старца: по пожеланию Илариона Грузина новый храм был освящён в честь Воскресения Христова.