Однако исследователи не исключают, что участники Собора освободили «общины Колумбы» от подчинения епископам для создания монастырской конгрегации по континентальному образцу. Структура воссозданной «общины Колумбы» остаётся неясной. Так, основанные Собором в Кенаннасе (1152 г.) епископские кафедры в Кенаннасе и Рат-Эо в соответствии с постановлениями 1158 г. должны были перейти под контроль Флатбертаха, не имевшего сана епископа. Флатбертах сопровождал Мурьхертаха Мак Лохланна во время путешествия в область Миде. В 1161 г. Флатбертах созвал там собрание духовной и светской знати, на котором церкви св. Колумбы в Миде и в Лагене (Лейнстере) были объявлены свободными от всех повинностей в пользу светских лиц. После возвращения правителя и настоятеля на север в Дайре были проведены строительные работы по обособлению церковного ансамбля от светского поселения и по сооружению каменной церкви (1162–1164 гг.). О влиянии Флатбертаха свидетельствует обращение к нему руководства обители на острове Иона с просьбой занять должность аббата монастыря по приглашению правителя Гебридских островов Сомарлида и знати Западной Шотландии (1164 г.). Однако Флатбертах, как полагают исследователи, по настоянию архиепископа Гиллы Мак Лиага, отказался от приглашения, сделав невозможным восстановление «общины Колумбы» в прежнем виде. Оппозиция власти Мурьхертаха Мак Лохланна и гибель правителя (1166 г.) окончательно расстроили планы возрождения конгрегации. Вопреки желанию Флатбертаха тело правителя было погребено в Ард-Махе, а его владения разделены. Новый верховный правитель Руадри Уа Конхобар, живший в Коннахте, принял Дайре под своё покровительство (1168 г.), однако развитию отношений воспрепятствовало англо-нормандское завоевание. По мере захвата англо-нормандцами ирландских территорий обители из «общины Колумбы» отчуждались от конгрегации. В 1176 г. нормандцы разорили Кенаннас и построили здесь укрепление. В 1179 г. папа  Римский Александр III закрепил обитель Рехра за канониками кафедрального собора в Дублине, Сорд вошёл в состав менсы Дублинской кафедры, Мон-Колум перешёл во владение епископства Глендалох. По мнению исследователей, ещё при жизни Флатбертаха произошёл окончательный распад конгрегации. Несмотря на то что аббат Гилла Мак Лиаг Уа Бранан, избранный в 1175 г., носил титул «преемник Колумбы», в действительности он оставался лишь настоятелем Дайре. Тем не менее, ещё в начале XIII в. в Северной Ирландии сохранялись представления о единстве церковных общин Ионы. Из-за недостатка источников история «общины Колумбы» в Шотландии в VIII в. исследователям почти неизвестна. Они предполагают, что в начале IX в. княжество Дал-Риада оказалось под властью пиктских правителей, которые были обеспокоены наметившейся тенденцией к перенесению центра «общины Колумбы» в Ирландию. Правитель Константин, сын Фергуса (ум. в 820 г.), основал новую обитель в Дун-Каллене (ныне Данкелд), которая, как полагают исследователи, рассматривалась как альтернатива Кенаннасу в Шотландии. Согласно «Шотландской хронике» (X в.), правитель Кинаэд (Кеннет) мак Алпин (842–858 гг.) объединил Шотландию, создав государство Альба, и перенёс в Дун-Каллен мощи св. Колумбы.