Когда Ива вернулся из Берита, он обнаружил смятение в своей церкви и враждебное отношение к себе со стороны паствы и особенно монашествующих. В результате был вынужден покинуть город и даже обратиться к магистру армии Востока с просьбой предоставить ему личную охрану. Император Феодосий II распорядился провести новое следствие по делу Ивы непосредственно в Эдессе и поручил это комиту провинции Осроена Херее. Прибыв в Эдессу 12 апреля 449 г., Херея был встречен толпой монахов, выкрикивавших оскорбления в адрес Ивы и называвших его вторым Иудой, фараоном, антихристом и т.п. 14 апреля комит приступил к расследованию без Ивы, т.к. его в это время в городе не было. В течение трёх дней Херея не принял окончательного решения, и это вызвало новую волну выступлений против Ивы. 17 апреля, во время воскресного богослужения, произошли беспорядки в церкви, и комит, чтобы успокоить народ, обещал отменить постановления беритской комиссии. На следующий день он вновь выслушал уже неоднократно разбиравшиеся обвинения Ивы в ереси. Процесс сопровождался выкриками толпы, требовавшей изгнания и даже смерти епископа. Херея признал обоснованными все обвинения и известил об этом императора. 27 июня 449 г. последовало распоряжение императора Феодосия II о признании Ивы виновным, лишении его кафедры, а также о том, чтобы на его место был избран православный епископ, которым стал Нонн. Иве было запрещено возвращаться в Эдессу; вскоре он был арестован и два года провёл в ссылках и заточении. Фактически Ива. был лишён кафедры по распоряжению светской власти, его церковное соборное осуждение имело место только в августе 449 г. на «Разбойничьем» Соборе под председательством Диоскора Александрийского. Дело Ивы обсуждалось на втором заседании 22 августа 449 г. Собор пожелал сначала заслушать участников беритской комиссии. Те, не излагая сути принятых ими постановлений, жаловались на то, что не имели возможности выявить истину, находясь вдали от Эдессы, и предложили обратиться к материалам следствия Хереи, получившим одобрение императора. Собор последовал совету, были приглашены обвинявшие Иву эдесские монахи и зачитаны обвинения и решения следственной комиссии Хереи. Чтение было прервано возгласами негодования и оскорблениями в адрес Ивы, а также требованиями заживо сжечь его вместе с Несторием. Когда возмущение улеглось, пресвитер Евлогий, не возобновляя чтение документов эдесского следствия, изложил перед Собором кратко суть их содержания.