Происхождение и датировка списка (не сохранился) из Воскресенского собора Смольного монастыря исследователям неизвестны. Икона обнаружена в 1850 гг. на складе старых церковных вещей монастыря и поставлена в соборе по распоряжению его настоятеля Николая Фёдоровича Раевского. Исследователи полагают, что икона первоначально принадлежала одной из монахинь обители и после её кончины поступила в монастырский храм во имя равноапостольной Марии Магдалины, после упразднения монастыря (1835 г.) была передана собору. Встречающееся в литературе XIX в. отождествление этого образа с иконой, подаренной императору Петру I в 1696 г. и переданной императрицей Елизаветой Петровной монастырю, по мнению исследователей, не имеет оснований. Размеры списка иконы меньше размеров оригинала (71,12х49 см), иконографии отличаются друг от друга: на списке отсутствует изображение рамы с дополнительными сюжетами и текстами. Ко времени прославления образ не имел ризы и венцов. Исследователям неясны и обстоятельства прославления иконы. В популярной литературе отражена версия, согласно которой икона была найдена 18 июня 1851 г. по описанию некоего гвардейского унтер-офицера, которому образ явился во сне. С разрешения Санкт-Петербургского митрополита Никанора (Клементьевского) обретённый образ был поставлен в соборе у правого столпа, перед ним служили молебны. Вскоре он стал самой чтимой иконой в соборе, был заключён в золочёную раму и украшен серебряным позолоченным окладом с драгоценными камнями. В 1891 г. для иконы соорудили золочёный киот в память чудесного спасения императора Александра III и его семьи 17 октября 1888 г. С 1892 г. на праздник Преображения икону носили крестным ходом вокруг местных фабрик. От образа зафиксировано несколько чудес: по молитвам перед иконой избежал пожара извозчичий двор, принадлежавший вдове купца Анне Григорьевне Прокофьевой; бывшая сестра милосердия А.А. Коробова исцелилась от болезни глаз; жена крестьянина Тверской губернии О. Арсеньева 21 ноября 1901 г. излечилась от болезни, которой страдала шесть лет. В Гефсиманский в честь Черниговской иконы Божьей Матери мужской скит в 1852 г. был вложен список Ильинской Черниговской иконы (93,35х66,68 см), история которого прослеживается с начала XIX в. Он находился в доме клирика Хотьковского в честь Покрова Пресвятой Богородицы женского монастыря священника Ивана Алексеева, получившего икону от одного из монахов Троице-Сергиевой лавры. В 1826 г. священник благословил этой иконой жившую в его доме девицу Александру Григорьевну Филиппову, которая позднее решила передать образ в храм. По благословению наместника Троице-Сергиевой лавры икона была поставлена в пещерном храме архангела Михаила в Гефсиманском скиту, для А.Г. Филипповой был сделан точный список, который она завещала храму Дома призрения при Троице-Сергиевой лавре.