В грамоте Константина Радзивилла отмечено, что такое решение одобрили «старшие религии греческой», о чём говорят «listy» («письма») Иерусалимского патриарха и экзарха Константинопольского патриарха. Исследователям известно, что Андрей Мужиловский посетил Иерусалимского патриарха Феофана IV, и 6 июня 1620 г. Феофан и экзарх Арсений объявили Слуцкое братство патриаршей ставропигией. Исследователи полагают, что тогда же были написаны и упомянутые в грамоте Константина Радзивилла «listy». В итоге церковь Спаса со всем принадлежавшим ей имуществом, одна из девяти «русских» церквей города, была передана Андрею Мужиловскому «до смерти». К началу 1620 гг. Слуцкая протопопия была вакантной, обязанности протопопа выполнял архимандрит слуцкого во имя Святой Троицы монастыря Михаил (Загоровский), сын князя Загоровского. Став протопопом, Андрей Мужиловский должен был считаться с тем, что первенство в духовных делах в Слуцком повете принадлежало слуцкому архимандриту. Андрей Мужиловский дал обязательство уважать управление архимандрита Михаила (Загоровского) и не вмешиваться в дела подчинённого тому духовенства. Исследователи полагают, что Андрей Мужиловский и архимандрит Михаил (Загоровский) влияли на замещение православных приходов в местных княжествах. В Слуцке Андрей Мужиловский в союзе с протестантами включился в борьбу против унии. Протопоп поддерживал тесные связи с Виленским православным Свято-Духовским братством, которое осталось единственным центром православия в столице Великого княжества Литовского. Андрей Мужиловский был посредником между митрополией в Киеве и Константином Радзивиллом; исследователям известны четыре письма Андрея Мужиловского к Константину Радзивиллу, написанные из Киева в Слуцк: от 15 июля 1621 г., от 3 августа и от 16 декабря 1623 г., от 13 февраля 1624 г. Андрей Мужиловский сообщал митрополиту в Киев сведения о православии в Вильно. После ареста в 1621 г. в Вильно 12 православных мещан Андрей Мужиловский сообщил об этом митрополиту Иову (Борецкому), который вместе с казаками выступил с акцией протеста. Андрей Мужиловский имел связи с запорожским казачеством, в Речи Посполитой считался компетентным экспертом в контактах с казаками. Слуцкий протопоп участвовал в совещаниях запорожской старшины, о которых в 1621–1624 гг. сообщал Константину Радзивиллу. В апреле 1621 г. гетман Яков Адамович Бородавка встретился в Киеве с митрополитом Иовом (Борецким) и с Андреем Мужиловским. Для казаков слуцкий протопоп был источником информации о виленских делах (об этом писал Яков Бородавка Константину Радзивиллу 8 мая 1621 г.). Часто выезжая в Киев, Андрей Мужиловский имел контакты с православными епископами и игуменами крупных монастырей, например, киевского Златоверхого во имя архангела Михаила. Его добрым знакомым был и будущий противник – Полоцкий архиепископ Мелетий (Смотрицкий), с которым Андрей Мужиловский состоял в переписке. В конце 1623 – начале 1624 гг. Андрей Мужиловский включился в процесс объединения православной и униатской церквей, который был начат униатским митрополитом Иосифом Вельямином Рутским. В ноябре 1623 г. в Киеве состоялось совещание, на котором присутствовали с православной стороны митрополит Иов (Борецкий) и архиепископ Мелетий (Смотрицкий), с униатской стороны – Ян Дубович.