Древняя Владимирская икона Божьей Матери, в честь встречи которой был основан монастырь, находилась в обители весьма краткие периоды. Исследователи полагают, что с момента основания Московского Сретенского монастыря храмовым его образом был специально выполненный список чудотворной иконы (не сохранился). В монастыре почитается список Владимирской иконы Божьей Матери (конец XX в.), которым при основании подворья Псково-Печерского монастыря благословил архимандрита Тихона (Шевкунова) архимандрит Иоанн (Крестьянкин). Икона находится в Сретенском соборе на северном столпе; также здесь располагается образ преподобного Серафима Саровского с частицей его мощей. В крипте собора помещены фотокопии (негатив и позитив) Туринской плащаницы в натуральную величину, освящённые в 1997 г. патриархом Алексием II (Ридигером) как Нерукотворные образы Иисуса Христа. 17 июля 2008 г. группой паломников из Греции обители была подарена икона преподобного Арсения Каппадокийского с частицей мощей, написанная в мастерской скита святой Анны на Афоне; рядом с преподобным на иконе коленопреклонённо изображён преподобный Паисий Святогорец. В Московском Сретенском монастыре особенно почитаются священномученик Иларион (Троицкий), мощи которого в мае 1999 г. поставлены на солее собора у южной стены (25 мая 2017 г. торжественно перенесены на солею храма Новомучеников и исповедников Церкви Русской); преподобная Мария Египетская (частица мощей принесена 25 марта 2004 г. из монастыря святителя Николая Чудотворца на греческом острове Андрос, находится в Мариинском приделе); Царственные страстотерпцы император Николай II с супругой и детьми, которые изображены на редкой иконе «Снятие пятой печати» (1997 г.), помещённой в иконостасе собора. Сюжетом образа послужили слова апостола Иоанна Богослова: «И когда Он снял пятую печать, я увидел под жертвенником души убиенных за слово Божие и за свидетельство, которое они имели. И возопили они громким голосом, говоря: доколе, Владыка Святой и Истинный, не судишь и не мстишь живущим на земле за кровь нашу? И даны были каждому из них одежды белые, и сказано им, чтобы они успокоились еще на малое время, пока и сотрудники их и братья их, которые будут убиты, как и они, дополнят число» (Откр. 6:9–11).