В 1929 г. на заседании Президиума Московского областного исполнительного комитета и Московского совета РК и КД обсуждался вопрос о «сносе церкви Марии Египетской бывшего Сретенского монастыря»; было решено, что «хотя церковь Марии Египетской, постройки 14 века, и является первоклассным памятником старины, однако вследствие ветхого и полуразрушенного состояния дальнейшее сохранение её невозможно» (Центральный государственный архив Московской области). В 1930 г. Президиум Московского областного исполнительного комитета и Московского совета РК и КД постановил: «1. Передать ОГПУ для постройки школы земельный участок владений № 19 и 17 по ул. Дзержинского… 2. Разрешить ОГПУ снести на передаваемом участке все строения с возмещением их стоимости и с предоставлением проживающим в них гражданам (имеющим право на площадь) годной жилой площади в натуре и транспортных средств на переселение… 3. Существующую на передаваемом участке церковь – собор бывшего Сретенского монастыря – ликвидировать и здание её снести, возбудив ходатайство перед ВЦИКом об утверждении настоящего постановления» (Центральный государственный архив Московской области). Монастырская территория отошла органам госбезопасности. Сохранились документальные свидетельства о проводившихся на территории обители многочисленных расстрелах. На месте монастырского кладбища в 1952 г. построили здание школы. В сохранившихся монастырских зданиях и в Сретенском соборе разместилось общежитие НКВД. В соборе было устроено несколько этажей, фрески закрашены и, по некоторым сведениям, устроен гараж. В 1958–1962 гг. был отреставрирован фасад собора, убраны пристройки, и с 1965 г. в нём разместилась Государственная центральная художественно-научно-реставрационная мастерская, а с 1974 г. – Всесоюзный художественный научно-реставрационный центр имени Игоря Эммануиловича Грабаря. В январе 1991 г. здание собора было передано РПЦ. В 1993 г. в монастыре было открыто подворье Псково-Печерского в честь Успения Пресвятой Богородицы монастыря. Первое богослужение на подворье состоялось 14 февраля 1994 г. В июле 1995 г. решением Синода РПЦ подворье было преобразовано в ставропигиальный монастырь, его наместником назначен игумен Тихон (Шевкунов; впоследствии епископ Егорьевский). 8 сентября 1995 г. в Московском Сретенском монастыре праздновалось 600-летие Сретения Владимирской иконы Божьей Матери. 7 сентября из Успенского собора Кремля в монастырь отправился торжественный крестный ход со списком Владимирской иконы. Его возглавил Патриарх Московский и всея Руси АлексийII (Ридиггер) с собором епископов и другого духовенства.