В конце июня 1923 г. епископ Иларион (Троицкий) вернулся в Москву и 5 июля заново освятил Сретенский собор, накануне празднования в честь Владимирской иконы Божьей Матери. В тот день храм не смог вместить всех пришедших, был заполнен даже монастырский двор. Епископ Иларион (Троицкий) произнёс проповедь, в которой обратился к священству, вступившему в обновленческие группы, чтобы они покаялись всенародно. Присутствующее духовенство публично покаялось, и владыка Иларион (Троицкий) освятил церковь. На следующий день, как и ожидалось, Божественную литургию в монастыре совершил патриарх Тихон (Беллавин). Перед причастием епископ Иларион (Троицкий) произнёс яркую проповедь. После литургии патриарх объявил о возведении епископа Илариона (Троицкого) в сан архиепископа. 15 ноября 1923 г. он был вновь арестован, 7 декабря приговорён к трём годам заключения за «распространение ложных слухов и агитацию против советской власти под религиозным флагом»; 28 декабря 1929 г. архиепископ Иларион(Троицкий) скончался. В 1924 г. властями неоднократно прилагались усилия к закрытию Московского Сретенского монастыря. В сентябре того же года Никольский храм был передан группе евангельских христиан для проведения молитвенных собраний, но Владимирский собор по-прежнему принадлежал братии. Весной-летом 1924 г. усилиями совета общины обители, в которой проживали семь насельников, а обязанности наместника исполнял игумен Виталий, были проведены ремонтные работы во Владимирском соборе. 8 сентября 1924 г. патриарх Тихон (Беллавин) совершил в Московском Сретенском монастыре Божественную литургию. 4 декабря 1925 г. в обители состоялся постриг в рясофор с именем Платон Сергея Михайловича Извекова (впоследствии Патриарх Московский и всея Руси Пимен). В 1925 г. Московский Сретенский монастырь возглавил епископ Борис (Рукин). После его перехода в григорианский раскол братия ушла из обители. Архимандрит Сергий (Плаксин) уехал к себе на родину – в село Милюково Смоленской области, он был арестован и 11 ноября 1937 г. по постановлению Тройки УГБ УНКВД расстрелян. 28 апреля 1925 г. Административным отделом Моссовета был рассмотрен вопрос о ликвидации часовни монастыря. В июне 1925 г. было принято решение «часовню закрыть, её помещение передать Жилищному Товариществу через МУНИ, а предметы культа передать по описи ближайшей группе верующих» (Центральный государственный архив Московской области). Среди братии обители к декабрю 1925 г. упоминаются наместник архимандрит Виталий, архимандрит Сергий, архимандрит Димитриан (Витохин), два игумена, иеромонах, иеродиакон, звонарь Гедике, диакон В. Шаронов. В 1926 г. обитель была закрыта. Сретенский собор некоторое время оставался приходским. 11 января 1928 г. заседание Президиума Московского совета РК и КД постановило «признать необходимым снести» в текущем году наряду с прочими «колокольню и помещение бывшей трапезной бывшего Сретенского монастыря по ул. Дзержинского (бывшая Большая Лубянка)» (Центральный государственный архив Московской области). В том же году была разобрана с целью «расширения уличного движения» Никольская церковь.