Управляющий Русскими подворьями Императорского Православного Палестинского общества в Иерусалиме Павел Иванович Ряжский в конфиденциальном донесении вице-председателю общества князю Алексею Александровичу Ширинскому-Шихматову от 4 мая 1914 г. сообщал, что Леонид «затратил в миссийские дела и все личные свои средства, полученные по наследству или накопленные сбережениями, тратит и всё своё жалованье». Среди других причин, сказавшихся на тяжёлом положении миссии, назывались «недостаток» у Леонида «честных и преданных помощников, интеллигентных и понимающих дело; своекорыстие его низших служащих, плохая организация контроля и отчётности». Леонид «отказался от назначения в епископы, потому что в настоящем виде не может сдать дел Миссии, а новый начальник не сможет их принять». В Санкт-Петербурге сочли необходимым провести ревизию финансового состояния Русской духовной миссии, и летом 1914 г. в Иерусалим был командирован помощник управляющего Синодальным контролем М.А. Дьяконов, отчёт которого подвёл итоги деятельности Русской духовной миссии при Леониде. Ревизия обнаружила, с одной стороны, огромную денежную задолженность миссии, а с другой – приобретение «на очень значительную по своей стоимости сумму» большого количества земель и проведение множества работ по их обустройству. Всё это в 1911–1913 гг. привело «денежные дела Миссии в критическое положение» при общей сумме долгов свыше 124 тыс. руб. Но главная причина полного расстройства дел Миссии, по заключению контролёра, была в «несоответствующем миссии, как учреждению духовному, направлении её деятельности». Леониду вменялось в вину то, что вопреки инструкции 1902 г., которая «не давала оснований к приобретению новых земельных участков» без разрешения Синода, он, отложив на второй план главные цели и задачи Русской духовной миссии, направил «свои силы и энергию на то, чтобы расширить и увеличить деятельность Миссии по организации и обслуживанию русского паломничества в Палестине с его материальной стороны». Отмечалось, что «даже настоящее стеснённое положение денежных дел Духовной Миссии не останавливает архимандрита Леонида от дальнейших попыток к приобретению новых земельных участков». Продолжалась и постройка нового храма в Горнем, несмотря на то что «община страдает от безденежья, не имеет даже средств для продовольствия, так что сёстрам приходится голодать», о чём начальник миссии писал Хозяйственному управлению в донесении от 20 апреля 1913 г. В отчёте отмечалась активная строительная деятельность Леонида на участках миссии. Но «при производстве строительных работ предварительного разрешения Св. Синода не испрашивалось, планы, фасады, эскизы и сметы не были представлены на утверждение ни в Св. Синоде, ни местным турецким властям; наконец, составление смет и планов, а равно и сами работы производились без участия архитектора». Но Леонид, окончивший техническое училище и имевший опыт строительных работ, не видел в этом необходимости. Неудовлетворительным оказалось и ведение отчётных книг по деятельности миссии.