В 1944 г. при освобождении Корца авиабомбой были повреждены один из корпусов и шесть келий рядом с Троицким храмом. Отступавшие нацисты уничтожили монастырский сад. Осенью 1945 г. местным райисполкомом были реквизированы здания Воскресенского монастыря под склады зерна. В «пользовании» сестёр оставили храмы и монастырское кладбище, затем «за несовместимостью» в 1946 г. храм закрыли, а новое монастырское кладбище перенесли к городскому Георгиевскому кладбищу. Имущество перевезли в Троицкую обитель. После кончины 14 ноября 1946 г. игуменьи Феофании (Павлюк-Задворной) Корецкий во имя Святой Троицы женский монастырь возглавила игуменья Магдалина (Крисько; до 1954 г.). 13 февраля 1950 г. по распоряжению епископа Волынского и Ровенского Панкратия (Кашперука) к Корецкому во имя Святой Троицы женскому монастырю в качестве подворья был приписан скит, расположенный в Белевских Хуторах. В октябре 1954 г., после назначения настоятельницей игуменьи Евлогии (Омельчук), состоялся первый послевоенный постриг 18 послушниц в рясофор. С сентября 1956 г. монастырские золотошвейные мастерские принимали от воинских частей заказы на вышивку воротников и обшлагов и манжеток к парадным мундирам генералов Советской Армии. За выполненную работу Корецкий во имя Святой Троицы женский монастырь получил благодарность от Львовского военного округа. В 1958–1969 гг. Корецким во имя Святой Троицы женским монастырём управляла монахиня Людмила (Вельсовская). В 1959–1960 гг. в Корецкий во имя Святой Троицы женский монастырь перешли насельницы закрытого кременецкого в честь Богоявления монастыря во главе с игуменьей Анимаисой (Малеевой). 1 июля 1960 г. был закрыт Дерманский во имя Святой Троицы монастырь, 52 насельницы которого также переселились в Корец. К началу 1961 г. в Корецком во имя Святой Троицы женском монастыре проживали 192 сестры. С 1961 г. монахини и служители Корецкого во имя Святой Троицы женского монастыря притеснялись органами советской власти, предпринимались попытки захвата сестринского корпуса №2 и передачи его местной школе, отселения пожилых монахинь в Острожский дом престарелых и перевода «трудоспособных монахинь... на работу в индустриальные районы СССР». 6 мая 1962 г. под руководством председателя корецкого райисполкома Хижняка и начальника милиции Левина был сделан пролом монастырской ограды. Насельницы, проживавшие в корпусе №2, были изгнаны из Корецкого во имя Святой Троицы женского монастыря с помощью представителей милиции, причём «наиболее активная» сестра Татьяна (Мельничук) осуждена на 15 суток за хулиганство. 18 мая 1962 г. игуменья изложила ситуацию патриарху Алексию I (Симанскому), затем генпрокурору СССР Роману Андреевичу Руденко. Захват корпуса был временно остановлен. В августе 1962 г. был отправлен на покой священник Василий Яссиевич (в обители остался служить лишь 82-летний священник Давид), монастырский водитель П.В. Герус арестован и выслан как «тунеядец» на пять лет на каменные карьеры в посёлке Рокитное Ровенской области. 22 мая 1959 г. власти отобрали у Корецкого во имя Святой Троицы женского монастыря большую часть посевных земель. 24 ноября 1962 г. келейный корпус №2 был передан школе механизаторов, личные вещи сестёр были выброшены на улицу. В 1963 г. при вмешательстве патриарха удалось добиться назначения вторым священником обители игумена Севериана (Воронюка); монахиню Людмилу возвели в сан игуменьи, что значительно укрепило духовную жизнь обители. В том же году 15 насельниц были пострижены в мантию.