12 апреля 1795 г. указом императрицы Екатерины II Корецкий во имя Святой Троицы женский монастырь был возвращён православным. 25 июня того же года епископ Волынский и Житомирский Варлаам (Шишацкий) торжественно открыл Корецкий во имя Святой Троицы женский монастырь, корецкий городской священник Николай Савлучинский (как смотритель до назначения игуменьи) и священник Емельян Кульчинский в присутствии городничего секунд-майора Григория Чигринца приняли обитель. В Воскресенский монастырь вернулись пять сестёр во главе с монахиней Макарией, возглавлявшей общину в изгнании. У старшей сестры монахини Иосафаты не было обнаружено предыдущих описей имущества, которые василианки преднамеренно уничтожили вместе с другой документацией, свидетельствовавшей о принадлежности монастыря к православной церкви. 21 ноября 1795 г., после ремонта, священник Николай Савлучинский освятил главный престол Воскресенского храма. Затем была принята Клинецкая экономия, а её управляющим утверждён действующий посессор хорунжий Егор Мурацкий. При приёме экономии также не было обнаружено предыдущих описей, а подданные засвидетельствовали угон из Корецкого во имя Святой Троицы монастыря скота и поспешное переоформление документов на земли и движимое имущество в пользу католических помещиков сразу же после получения известия о переводе имений в православное ведомство. 17 мая 1796 г. решением консистории в Корецкий во имя Святой Троицы монастырь переехали сёстры упразднённого бывшего униатского Ясногорского Троицкого монастыря во главе с сестрой Марфой (Головинской), ставшей казначеей в обители. В 1797 г. в Острожском Преображенском монастыре сестра Марфа (Головинская) была возведена по православному чину в сан игуменьи. 19 августа 1797 г. полностью сгорели замок и большинство построек местечка, были разрушены храм и почти все кельи на верхних этажах. С разрешения епархиальной власти в помещении трапезной устроили временную церковь, 25 октября 1798 г. освящённую в честь Успения Пресвятой Богородицы. Позже храм был перестроен и 8 марта 1807 г. освящён в честь Благовещения Пресятой. Богородицы. В 1799–1800 гг. восстановительные работы в обители вела артель плотников и мастеров резного дела под руководством Симона Литмановича. К прилегавшему к храму корпусу были пристроены игуменские и архиерейские покои, на втором этаже восстановлены 26 келий, возобновлены хозяйственные помещения, устроены трапезная, дом священника, комната для отдыха духовенства, заложена колокольня. В 1800 г., в день празднования иконе Божьей Матери «Живоносный Источник», епископ Волынский Варлаам (Шишацкий) освятил восстановленный монастырь. При настоятельнице игуменьи Рахили (Жуковец; 1807–1814 гг.) Корецкий во имя Святой Троицы женский монастырь выделил 10 тыс. руб. серебром для поддержки русских войск в Отечественной войне 1812 г. Также обитель направила 12 добровольцев в народное ополчение из своих имений, снабдив их всем необходимым для несения службы. Насельницы во главе со священниками Гавриилом Симоновичем и Дмитрием Яворским, погрузив архив, облачение и драгоценности, эвакуировались в Золотоношский монастырь Полтавской губернии, где пребывали до января 1813 г.