Благодаря точности воспроизведения древних текстов публикации К.Ф. Калайдовича стали источником не только для исторических, но и для лингвистических и палеографических исследований. Этому же служили факсимильные изображения образцов почерков писцов различных рукописей, инициалов и заставок, помещённые в приложении к исследованию, и составленные К.Ф. Калайдовичем азбуки типичных начертаний букв. По богатству нового материала, привлечённого к исследованию, и выводам это сочинение К.Ф. Калайдовича занимает одно из первых мест в ряду трудов русских учёных по славянской филологии. На следующий год после выхода книги К.Ф. Калайдович был избран членом-корреспондентом Санкт-Петербургской Академии Наук. В процессе работы над исследованием об Иоанне Экзархе К.Ф. Калайдович ввёл в научный оборот хранившийся в московской Синодальной библиотеке болгарский сборник 1348 г., переписанный для царя Иоанна Александра и содержащий древнейшие списки «Написания о правой вере» с именем равноапостольного Кирилла Философа в заглавии и Сказания о письменах Черноризца Храбра. Под наблюдением К.Ф. Калайдовича печатались книги известных авторов: митрополита Евгения (Болховитинова), Петра Ивановича Кеппена и Дмитрия Николаевича Бантыш-Каменского, протоиерея Ивана Григоровича, к некоторым изданиям К.Ф. Калайдович делал дополнения («Каталог писателей, сочинениями своими объяснявших гражданскую и церковную российскую историю, сочиненный Адамом Селлием» / Перевод: епископ Евгений (Болховитинов). М., 1815 г.; «Летопись Несторова по древнейшему списку мниха Лаврентия / Издание: Роман Фёдорович Тимковский. М., 1824 г. [«Объяснительное предуведомление» К.Ф. Калайдовича]). Знаток собраний рукописей и старопечатных книг, К.Ф. Калайдович неизменно помогал учёным, в частности, доставил много материалов Н.М. Карамзину для «Истории государства Российского». Страстный любитель русских древностей, К.Ф. Калайдович почти ничего не приобретал для себя, но передавал находки в казённые или частные хранилища, сопровождая их реестрами, каталогами, объяснениями, оценками. Иногда эти пояснения были настолько обширны, что по существу являлись исследованиями. Особенно значительным был вклад К.Ф. Калайдовича в формирование коллекции графа Н.П. Румянцева. Подобную работу он выполнял и по поручению ОИДР, в которое по представлению К.Ф. Калайдовича было сделано много пожертвований.