В 1622 – начале 1623 гг. Иов стремился укрепить связи со своей главной опорой – Запорожским войском. О тесных контактах Иова с гетманом Петром Кононовичем Сагайдачным говорит тот факт, что, когда гетман в апреле 1622 г. умер, Иов по завещанию стал одним из его душеприказчиков. Иов рекомендовал нового гетмана Олифера Голуба в сентябре 1622 г. К. Радзивиллу, прося его о покровительстве Запорожскому войску. Преемник Олифера Голуба Богдан Конша в начале 1623 г. обратился к собравшемуся в это время сейму с уже традиционным требованием признания православной иерархии. Созыву сейма предшествовала агитационная кампания, организованная при активном участии Иова. К участникам сейма было обращено его сочинение «Подтверждение невинности», скреплённое подписями митрополита и епископов. В этом сочинении, которое развивало аргументы протестации, ещё более подробно и обстоятельно опровергались обвинения по адресу Иерусалимского патриарха Феофана и доказывалось, что право свободно исповедовать свою веру составляет часть «вольностей» русского народа, которому принадлежат в Речи Посполитой «равные права с народами польским и литовским». Митрополит и епископы заявляли, что не посягают на королевское право патроната и готовы уступить свои должности более достойным, которых представят королю для посвящения. Иной характер носила написанная Иовом «Покорнейшая просьба», представлявшая собой обращение православной шляхты к сенаторам. В документе после подробного описания гонений на православных следовало обращение к сенаторам с призывом, чтобы они, как стражи законов, приняли меры для прекращения гонений и «успокоения греческой религии». К тому времени, когда был созван сейм, руководящим кругам Речи Посполитой стало ясно, что устранить силой православную иерархию не удастся. В этих условиях они с пониманием отнеслись к инициативе униатского епископата, предложившего созвать Собор для «примирения» православных и униатов. Иову и архиепископу Мелетию (Смотрицкому) была послана грамота, гарантировавшая безопасность во время работы сейма, но в ней Иов не был назван митрополитом, а Мелетий – архиепископом. Направленное на сейм казацкое посольство требовало признания православной иерархии и возвращения православным епископам их храмов и имений. В инструкции послам говорилось о выдаче королевского привилея Киевскому братству и о необходимости создания в Киеве школы «для наук и обучения». В этих требованиях отразилось влияние Иова. Сейм, открывшийся в январе 1623 г., образовал комиссию из числа сенаторов и послов во главе с Гнезненским архиепископом Вавженецем Гембицким, которая организовала встречи с униатскими и православными иерархами. Иов и архиепископ Мелетий выступили здесь с протестом против преследований православных.