В сложное положение поставило сторонников архиепископа Григория заявление Ярославского митрополита Агафангела (Преображенского) о вступлении в права Патриаршего Местоблюстителя. Митрополит Агафангел был упомянут в завещании патриарха Тихона в качестве возможного преемника, но в момент смерти святителя находился в ссылке и был лишён возможности взять на себя исполнение патриарших обязанностей. В апреле 1926 г. с митрополитом Агафангелом встретился в Перми Е.А. Тучков, который, введя его в заблуждение относительно состояния церковных дел, убедил сделать 18 апреля заявление о вступлении в права Местоблюстителя. Антицерковная комиссия ЦК ВКП(б) на заседании 24 апреля постановила: «Проводимую ОГПУ линию по разложению тихоновской части церковников признать правильной и целесообразной. Вести линию на раскол между митрополитом Сергием, назначенным митрополитом Петром временным местоблюстителем, и митрополитом Агафангелом, претендующим на патриаршее местоблюстительство, укрепляя одновременно третью тихоновскую иерархию – временный Высший Церковный Совет во главе с архиепископом Григорием, как самостоятельную единицу». Для обсуждения создавшегося положения 3 июня 1926 г. в московском Донском монастыре открылся съезд сторонников григорианского раскола. Неясность вопроса о правопреемственности патриарших полномочий, по мнению архиепископа Григория, давала ВВЦС возможность участвовать в церковном управлении. 9 июня митрополит Пётр издал резолюцию об упразднении учреждённой им 1 февраля коллегии и подтвердил запрещения, наложенные митрополитом Сергием на архиепископа Григория и других архиереев, не подчинившихся законной церковной власти. В таких условиях ВВЦС попытался занять место коллегиального органа управления при митрополите Агафангеле, признав его истинным преемником патриарха Тихона. Однако митрополит Агафангел уже заявил об отказе от обязанностей Патриаршего Местоблюстителя. Попытки руководителей григорианского раскола уговорить митрополита Агафангела вернуться к Местоблюстительству и взять ВВЦС под свой покров оказались тщетными. Утратив даже видимость каноничности, ВВЦС терял приверженцев. В мае–июне 1926 г. принесли покаяния митрополиту Сергию архиепископ Владимир (Соколовский-Автономов), епископы Виссарион (Зорнин), Симеон (Михайлов), Ириней (Шульмин), Мелхиседек (Паевский), Тихон (Русинов), Вассиан (Пятницкий). К концу июня 1926 г. в григорианском расколе оставалось только семь иерархов. Для того чтобы восполнить убыль епископата, с лета 1926 г. ВВЦС стал проводить собственные «хиротонии». В ноябре–декабре 1926 г. ОГПУ провело новые массовые аресты православных архиереев. В связи с арестом митрополита Сергия исполнение патриарших полномочий перешло к Ленинградскому митрополиту Иосифу (Петровых), названному в завещательном распоряжении митрополита Петра.